Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC12.46□□□□□ -0.42
H2-Eb1P04230 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
H2-Eb1P04230 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
H2-Eb1P04230 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.42
H2-Eb1P04230 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.42
H2-Eb1P04230 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
H2-Eb1P04230 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
H2-Eb1P04230 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
H2-Eb1P04230 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
H2-Eb1P04230 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
H2-Eb1P04230 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
H2-Eb1P04230 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
H2-Eb1P04230 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
H2-Eb1P04230 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
H2-Eb1P04230 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
H2-Eb1P04230 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
H2-Eb1P04230 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
H2-Eb1P04230 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
H2-Eb1P04230 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
H2-Eb1P04230 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
H2-Eb1P04230 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
H2-Eb1P04230 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
H2-Eb1P04230 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
H2-Eb1P04230 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
H2-Eb1P04230 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
H2-Eb1P04230 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
H2-Eb1P04230 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
H2-Eb1P04230 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
H2-Eb1P04230 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
H2-Eb1P04230 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
H2-Eb1P04230 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
H2-Eb1P04230 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
H2-Eb1P04230 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
H2-Eb1P04230 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
H2-Eb1P04230 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
H2-Eb1P04230 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
H2-Eb1P04230 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
H2-Eb1P04230 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
H2-Eb1P04230 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
H2-Eb1P04230 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
H2-Eb1P04230 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
H2-Eb1P04230 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
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H2-Eb1P04230 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
H2-Eb1P04230 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
H2-Eb1P04230 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
H2-Eb1P04230 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
H2-Eb1P04230 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
H2-Eb1P04230 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
H2-Eb1P04230 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
H2-Eb1P04230 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
H2-Eb1P04230 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
H2-Eb1P04230 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
H2-Eb1P04230 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
H2-Eb1P04230 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
H2-Eb1P04230 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
H2-Eb1P04230 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
H2-Eb1P04230 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
H2-Eb1P04230 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
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H2-Eb1P04230 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
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H2-Eb1P04230 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
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H2-Eb1P04230 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
H2-Eb1P04230 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
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H2-Eb1P04230 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
H2-Eb1P04230 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
H2-Eb1P04230 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
H2-Eb1P04230 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
H2-Eb1P04230 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
H2-Eb1P04230 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
H2-Eb1P04230 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
H2-Eb1P04230 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
H2-Eb1P04230 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
H2-Eb1P04230 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
H2-Eb1P04230 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
H2-Eb1P04230 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
H2-Eb1P04230 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
H2-Eb1P04230 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
H2-Eb1P04230 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
H2-Eb1P04230 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
H2-Eb1P04230 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
H2-Eb1P04230 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
H2-Eb1P04230 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
H2-Eb1P04230 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
H2-Eb1P04230 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
H2-Eb1P04230 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
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