Protein–RNA interactions for Protein: P04214

T-cell receptor beta chain V region E1, mousemouse

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Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04214 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P04214 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
P04214 Itpr3os-201ENSMUST00000143605 794 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
P04214 Rsph14-206ENSMUST00000166088 1203 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
P04214 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
P04214 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
P04214 Rsph14-207ENSMUST00000179546 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P04214 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
P04214 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
P04214 Gm45460-201ENSMUST00000211385 1038 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
P04214 Gm34809-203ENSMUST00000222945 509 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
P04214 Rsph14-201ENSMUST00000009214 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P04214 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P04214 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
P04214 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
P04214 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P04214 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P04214 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
P04214 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P04214 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
P04214 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
P04214 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P04214 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P04214 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P04214 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P04214 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
P04214 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P04214 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P04214 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P04214 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P04214 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
P04214 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P04214 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P04214 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P04214 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P04214 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P04214 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P04214 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P04214 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
P04214 Pmp22-202ENSMUST00000108700 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P04214 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
P04214 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
P04214 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
P04214 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P04214 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P04214 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P04214 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
P04214 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P04214 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P04214 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P04214 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P04214 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
P04214 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
P04214 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P04214 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P04214 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
P04214 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P04214 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
P04214 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P04214 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P04214 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
P04214 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
P04214 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P04214 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
P04214 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
P04214 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
P04214 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
P04214 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P04214 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P04214 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
P04214 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P04214 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
P04214 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
P04214 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P04214 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
P04214 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
P04214 Gm11451-201ENSMUST00000118946 630 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
P04214 Gm11340-201ENSMUST00000119226 412 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
P04214 Prss46-201ENSMUST00000119427 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P04214 Gm12899-201ENSMUST00000120565 551 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
P04214 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
P04214 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P04214 Agtpbp1-216ENSMUST00000168821 721 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P04214 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P04214 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
P04214 Prss46-202ENSMUST00000176403 1257 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P04214 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P04214 AC124457.1-201ENSMUST00000198845 120 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
P04214 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P04214 Gm37419-201ENSMUST00000210705 114 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
P04214 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
P04214 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P04214 Gm9873-201ENSMUST00000063891 1097 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
P04214 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
P04214 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
P04214 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P04214 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P04214 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P04214 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
P04214 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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