Protein–RNA interactions for Protein: O88545

Cops6, COP9 signalosome complex subunit 6, mousemouse

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Length 324 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops6O88545 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cops6O88545 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cops6O88545 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cops6O88545 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cops6O88545 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cops6O88545 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cops6O88545 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cops6O88545 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cops6O88545 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cops6O88545 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cops6O88545 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cops6O88545 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cops6O88545 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cops6O88545 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cops6O88545 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cops6O88545 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cops6O88545 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cops6O88545 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cops6O88545 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cops6O88545 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cops6O88545 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cops6O88545 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cops6O88545 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cops6O88545 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cops6O88545 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cops6O88545 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cops6O88545 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cops6O88545 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cops6O88545 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cops6O88545 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cops6O88545 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cops6O88545 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cops6O88545 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cops6O88545 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cops6O88545 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cops6O88545 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cops6O88545 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cops6O88545 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cops6O88545 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cops6O88545 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cops6O88545 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cops6O88545 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cops6O88545 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cops6O88545 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cops6O88545 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cops6O88545 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cops6O88545 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cops6O88545 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cops6O88545 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cops6O88545 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cops6O88545 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cops6O88545 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cops6O88545 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cops6O88545 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cops6O88545 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cops6O88545 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cops6O88545 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cops6O88545 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cops6O88545 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cops6O88545 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
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Cops6O88545 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Cops6O88545 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Cops6O88545 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cops6O88545 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Cops6O88545 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cops6O88545 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cops6O88545 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cops6O88545 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cops6O88545 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Cops6O88545 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cops6O88545 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cops6O88545 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cops6O88545 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cops6O88545 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cops6O88545 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cops6O88545 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cops6O88545 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cops6O88545 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cops6O88545 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cops6O88545 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cops6O88545 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cops6O88545 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cops6O88545 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cops6O88545 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cops6O88545 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cops6O88545 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cops6O88545 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Cops6O88545 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cops6O88545 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cops6O88545 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cops6O88545 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Cops6O88545 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Cops6O88545 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Cops6O88545 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cops6O88545 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
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