Protein–RNA interactions for Protein: O70237

Gfi1b, Zinc finger protein Gfi-1b, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfi1bO70237 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gfi1bO70237 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gfi1bO70237 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gfi1bO70237 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gfi1bO70237 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gfi1bO70237 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gfi1bO70237 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gfi1bO70237 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gfi1bO70237 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gfi1bO70237 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gfi1bO70237 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gfi1bO70237 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gfi1bO70237 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gfi1bO70237 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gfi1bO70237 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gfi1bO70237 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gfi1bO70237 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gfi1bO70237 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gfi1bO70237 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gfi1bO70237 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gfi1bO70237 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gfi1bO70237 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gfi1bO70237 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gfi1bO70237 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gfi1bO70237 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gfi1bO70237 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gfi1bO70237 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gfi1bO70237 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gfi1bO70237 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gfi1bO70237 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gfi1bO70237 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gfi1bO70237 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gfi1bO70237 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gfi1bO70237 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gfi1bO70237 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gfi1bO70237 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gfi1bO70237 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gfi1bO70237 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gfi1bO70237 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gfi1bO70237 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gfi1bO70237 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gfi1bO70237 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gfi1bO70237 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gfi1bO70237 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gfi1bO70237 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gfi1bO70237 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gfi1bO70237 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gfi1bO70237 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gfi1bO70237 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gfi1bO70237 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gfi1bO70237 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gfi1bO70237 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gfi1bO70237 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gfi1bO70237 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gfi1bO70237 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gfi1bO70237 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gfi1bO70237 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gfi1bO70237 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gfi1bO70237 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gfi1bO70237 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gfi1bO70237 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gfi1bO70237 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gfi1bO70237 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gfi1bO70237 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gfi1bO70237 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gfi1bO70237 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Gfi1bO70237 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gfi1bO70237 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gfi1bO70237 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gfi1bO70237 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gfi1bO70237 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gfi1bO70237 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gfi1bO70237 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gfi1bO70237 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gfi1bO70237 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gfi1bO70237 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gfi1bO70237 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Gfi1bO70237 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gfi1bO70237 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Gfi1bO70237 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gfi1bO70237 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Gfi1bO70237 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gfi1bO70237 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gfi1bO70237 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gfi1bO70237 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gfi1bO70237 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gfi1bO70237 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gfi1bO70237 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gfi1bO70237 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gfi1bO70237 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Gfi1bO70237 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gfi1bO70237 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gfi1bO70237 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gfi1bO70237 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gfi1bO70237 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gfi1bO70237 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gfi1bO70237 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gfi1bO70237 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gfi1bO70237 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gfi1bO70237 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
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