Protein–RNA interactions for Protein: O54909

Rdh16, Cis-retinol androgen dehydrogenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh16O54909 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rdh16O54909 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rdh16O54909 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rdh16O54909 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rdh16O54909 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rdh16O54909 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rdh16O54909 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rdh16O54909 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rdh16O54909 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rdh16O54909 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rdh16O54909 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rdh16O54909 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rdh16O54909 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rdh16O54909 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rdh16O54909 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rdh16O54909 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rdh16O54909 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rdh16O54909 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Rdh16O54909 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Rdh16O54909 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rdh16O54909 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rdh16O54909 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rdh16O54909 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rdh16O54909 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rdh16O54909 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rdh16O54909 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rdh16O54909 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rdh16O54909 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rdh16O54909 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rdh16O54909 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rdh16O54909 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rdh16O54909 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rdh16O54909 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rdh16O54909 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rdh16O54909 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rdh16O54909 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rdh16O54909 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rdh16O54909 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rdh16O54909 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rdh16O54909 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rdh16O54909 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Rdh16O54909 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Rdh16O54909 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rdh16O54909 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rdh16O54909 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rdh16O54909 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rdh16O54909 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rdh16O54909 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rdh16O54909 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rdh16O54909 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rdh16O54909 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rdh16O54909 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rdh16O54909 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rdh16O54909 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rdh16O54909 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rdh16O54909 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rdh16O54909 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rdh16O54909 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rdh16O54909 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rdh16O54909 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Rdh16O54909 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Rdh16O54909 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rdh16O54909 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rdh16O54909 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rdh16O54909 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rdh16O54909 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rdh16O54909 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rdh16O54909 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rdh16O54909 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rdh16O54909 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rdh16O54909 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rdh16O54909 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rdh16O54909 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rdh16O54909 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rdh16O54909 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rdh16O54909 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rdh16O54909 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rdh16O54909 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rdh16O54909 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rdh16O54909 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rdh16O54909 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rdh16O54909 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rdh16O54909 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rdh16O54909 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rdh16O54909 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rdh16O54909 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rdh16O54909 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Rdh16O54909 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rdh16O54909 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rdh16O54909 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rdh16O54909 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Rdh16O54909 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rdh16O54909 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rdh16O54909 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rdh16O54909 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rdh16O54909 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rdh16O54909 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rdh16O54909 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rdh16O54909 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rdh16O54909 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms