Protein–RNA interactions for Protein: O54887

Tsks, Testis-specific serine kinase substrate, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TsksO54887 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TsksO54887 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TsksO54887 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TsksO54887 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TsksO54887 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TsksO54887 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TsksO54887 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TsksO54887 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TsksO54887 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TsksO54887 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TsksO54887 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TsksO54887 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TsksO54887 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TsksO54887 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TsksO54887 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TsksO54887 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TsksO54887 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TsksO54887 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TsksO54887 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TsksO54887 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TsksO54887 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TsksO54887 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TsksO54887 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TsksO54887 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TsksO54887 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TsksO54887 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TsksO54887 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TsksO54887 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TsksO54887 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TsksO54887 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TsksO54887 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TsksO54887 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TsksO54887 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TsksO54887 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TsksO54887 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TsksO54887 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TsksO54887 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TsksO54887 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TsksO54887 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TsksO54887 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TsksO54887 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TsksO54887 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TsksO54887 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TsksO54887 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TsksO54887 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TsksO54887 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TsksO54887 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TsksO54887 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TsksO54887 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TsksO54887 Gm29331-201ENSMUST00000187215 605 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TsksO54887 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TsksO54887 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TsksO54887 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TsksO54887 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TsksO54887 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TsksO54887 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TsksO54887 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TsksO54887 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TsksO54887 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TsksO54887 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TsksO54887 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TsksO54887 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TsksO54887 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TsksO54887 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TsksO54887 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TsksO54887 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TsksO54887 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TsksO54887 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TsksO54887 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TsksO54887 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TsksO54887 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TsksO54887 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TsksO54887 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TsksO54887 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TsksO54887 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TsksO54887 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TsksO54887 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TsksO54887 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TsksO54887 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
TsksO54887 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TsksO54887 Gm12439-201ENSMUST00000117162 365 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TsksO54887 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TsksO54887 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TsksO54887 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TsksO54887 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TsksO54887 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TsksO54887 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TsksO54887 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
TsksO54887 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TsksO54887 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TsksO54887 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TsksO54887 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TsksO54887 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TsksO54887 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TsksO54887 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TsksO54887 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TsksO54887 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TsksO54887 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TsksO54887 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TsksO54887 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms