Protein–RNA interactions for Protein: O35988

Sdc4, Syndecan-4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc4O35988 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sdc4O35988 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sdc4O35988 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Sdc4O35988 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sdc4O35988 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sdc4O35988 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sdc4O35988 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sdc4O35988 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Sdc4O35988 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Sdc4O35988 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sdc4O35988 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Sdc4O35988 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sdc4O35988 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sdc4O35988 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sdc4O35988 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sdc4O35988 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sdc4O35988 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sdc4O35988 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sdc4O35988 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sdc4O35988 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sdc4O35988 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sdc4O35988 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Sdc4O35988 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sdc4O35988 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sdc4O35988 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sdc4O35988 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sdc4O35988 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sdc4O35988 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sdc4O35988 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sdc4O35988 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sdc4O35988 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sdc4O35988 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sdc4O35988 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Sdc4O35988 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Sdc4O35988 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sdc4O35988 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sdc4O35988 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sdc4O35988 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Sdc4O35988 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Sdc4O35988 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sdc4O35988 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sdc4O35988 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sdc4O35988 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Sdc4O35988 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sdc4O35988 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sdc4O35988 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sdc4O35988 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sdc4O35988 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sdc4O35988 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sdc4O35988 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sdc4O35988 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Sdc4O35988 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sdc4O35988 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sdc4O35988 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sdc4O35988 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sdc4O35988 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sdc4O35988 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sdc4O35988 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sdc4O35988 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sdc4O35988 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sdc4O35988 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sdc4O35988 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sdc4O35988 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sdc4O35988 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sdc4O35988 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sdc4O35988 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sdc4O35988 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sdc4O35988 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sdc4O35988 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sdc4O35988 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sdc4O35988 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sdc4O35988 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sdc4O35988 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sdc4O35988 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sdc4O35988 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sdc4O35988 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sdc4O35988 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sdc4O35988 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sdc4O35988 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Sdc4O35988 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sdc4O35988 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sdc4O35988 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Sdc4O35988 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Sdc4O35988 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Sdc4O35988 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sdc4O35988 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sdc4O35988 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sdc4O35988 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sdc4O35988 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sdc4O35988 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sdc4O35988 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sdc4O35988 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Sdc4O35988 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sdc4O35988 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sdc4O35988 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sdc4O35988 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sdc4O35988 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sdc4O35988 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sdc4O35988 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sdc4O35988 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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