Protein–RNA interactions for Protein: O35892

Sp100, Nuclear autoantigen Sp-100, mousemouse

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Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp100O35892 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Sp100O35892 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Sp100O35892 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Sp100O35892 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Sp100O35892 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Sp100O35892 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Sp100O35892 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Sp100O35892 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Sp100O35892 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Sp100O35892 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Sp100O35892 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Sp100O35892 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Sp100O35892 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Sp100O35892 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Sp100O35892 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Sp100O35892 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Sp100O35892 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Sp100O35892 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Sp100O35892 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Sp100O35892 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Sp100O35892 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Sp100O35892 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Sp100O35892 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Sp100O35892 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Sp100O35892 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Sp100O35892 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Sp100O35892 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
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Sp100O35892 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Sp100O35892 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Sp100O35892 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Sp100O35892 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Sp100O35892 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Sp100O35892 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Sp100O35892 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Sp100O35892 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Sp100O35892 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Sp100O35892 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Sp100O35892 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Sp100O35892 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Sp100O35892 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Sp100O35892 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Sp100O35892 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Sp100O35892 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Sp100O35892 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Sp100O35892 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Sp100O35892 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Sp100O35892 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Sp100O35892 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Sp100O35892 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Sp100O35892 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Sp100O35892 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Sp100O35892 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Sp100O35892 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Sp100O35892 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
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Sp100O35892 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Sp100O35892 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
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Sp100O35892 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
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Sp100O35892 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Sp100O35892 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Sp100O35892 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Sp100O35892 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Sp100O35892 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Sp100O35892 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Sp100O35892 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Sp100O35892 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Sp100O35892 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Sp100O35892 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Sp100O35892 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Sp100O35892 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Sp100O35892 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Sp100O35892 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Sp100O35892 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sp100O35892 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sp100O35892 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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