Protein–RNA interactions for Protein: O35599

Opn1mw, Medium-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

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Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1mwO35599 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Opn1mwO35599 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Opn1mwO35599 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Opn1mwO35599 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Opn1mwO35599 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Opn1mwO35599 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Opn1mwO35599 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Opn1mwO35599 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Opn1mwO35599 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Opn1mwO35599 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Opn1mwO35599 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Opn1mwO35599 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Opn1mwO35599 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Opn1mwO35599 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Opn1mwO35599 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Opn1mwO35599 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Opn1mwO35599 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Opn1mwO35599 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Opn1mwO35599 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Opn1mwO35599 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Opn1mwO35599 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Opn1mwO35599 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Opn1mwO35599 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Opn1mwO35599 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Opn1mwO35599 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Opn1mwO35599 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Opn1mwO35599 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Opn1mwO35599 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Opn1mwO35599 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Opn1mwO35599 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Opn1mwO35599 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Opn1mwO35599 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Opn1mwO35599 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Opn1mwO35599 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Opn1mwO35599 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Opn1mwO35599 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Opn1mwO35599 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Opn1mwO35599 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Opn1mwO35599 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Opn1mwO35599 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Opn1mwO35599 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Opn1mwO35599 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Opn1mwO35599 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Opn1mwO35599 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Opn1mwO35599 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Opn1mwO35599 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Opn1mwO35599 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Opn1mwO35599 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Opn1mwO35599 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Opn1mwO35599 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Opn1mwO35599 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Opn1mwO35599 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Opn1mwO35599 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Opn1mwO35599 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Opn1mwO35599 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Opn1mwO35599 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Opn1mwO35599 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Opn1mwO35599 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Opn1mwO35599 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Opn1mwO35599 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Opn1mwO35599 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Opn1mwO35599 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Opn1mwO35599 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Opn1mwO35599 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Opn1mwO35599 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Opn1mwO35599 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
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Opn1mwO35599 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Opn1mwO35599 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Opn1mwO35599 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Opn1mwO35599 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Opn1mwO35599 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Opn1mwO35599 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Opn1mwO35599 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Opn1mwO35599 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Opn1mwO35599 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Opn1mwO35599 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Opn1mwO35599 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Opn1mwO35599 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Opn1mwO35599 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Opn1mwO35599 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Opn1mwO35599 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Opn1mwO35599 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Opn1mwO35599 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Opn1mwO35599 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Opn1mwO35599 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Opn1mwO35599 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Opn1mwO35599 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Opn1mwO35599 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Opn1mwO35599 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Opn1mwO35599 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Opn1mwO35599 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Opn1mwO35599 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Opn1mwO35599 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Opn1mwO35599 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Opn1mwO35599 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms