Protein–RNA interactions for Protein: O35173

Kcns1, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 1, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcns1O35173 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Kcns1O35173 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Kcns1O35173 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Kcns1O35173 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Kcns1O35173 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Kcns1O35173 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Kcns1O35173 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Kcns1O35173 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Kcns1O35173 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Kcns1O35173 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Kcns1O35173 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Kcns1O35173 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Kcns1O35173 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Kcns1O35173 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Kcns1O35173 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Kcns1O35173 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Kcns1O35173 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Kcns1O35173 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Kcns1O35173 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Kcns1O35173 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Kcns1O35173 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Kcns1O35173 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Kcns1O35173 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Kcns1O35173 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Kcns1O35173 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Kcns1O35173 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Kcns1O35173 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Kcns1O35173 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Kcns1O35173 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Kcns1O35173 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Kcns1O35173 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Kcns1O35173 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Kcns1O35173 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Kcns1O35173 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Kcns1O35173 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Kcns1O35173 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Kcns1O35173 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Kcns1O35173 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Kcns1O35173 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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Kcns1O35173 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Kcns1O35173 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Kcns1O35173 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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Kcns1O35173 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Kcns1O35173 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Kcns1O35173 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Kcns1O35173 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Kcns1O35173 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Kcns1O35173 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Kcns1O35173 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Kcns1O35173 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Kcns1O35173 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Kcns1O35173 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Kcns1O35173 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Kcns1O35173 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Kcns1O35173 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Kcns1O35173 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Kcns1O35173 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Kcns1O35173 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Kcns1O35173 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Kcns1O35173 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Kcns1O35173 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Kcns1O35173 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Kcns1O35173 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Kcns1O35173 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Kcns1O35173 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
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Kcns1O35173 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Kcns1O35173 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
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