Protein–RNA interactions for Protein: M0QW46

Ascl4, Achaete-scute family bHLH transcription factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ascl4M0QW46 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Ascl4M0QW46 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ascl4M0QW46 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ascl4M0QW46 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Ascl4M0QW46 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ascl4M0QW46 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ascl4M0QW46 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ascl4M0QW46 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ascl4M0QW46 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ascl4M0QW46 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ascl4M0QW46 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ascl4M0QW46 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ascl4M0QW46 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ascl4M0QW46 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ascl4M0QW46 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ascl4M0QW46 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ascl4M0QW46 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ascl4M0QW46 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ascl4M0QW46 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ascl4M0QW46 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ascl4M0QW46 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ascl4M0QW46 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ascl4M0QW46 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC10.71□□□□□ -0.7
Ascl4M0QW46 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ascl4M0QW46 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ascl4M0QW46 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ascl4M0QW46 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ascl4M0QW46 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ascl4M0QW46 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ascl4M0QW46 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ascl4M0QW46 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ascl4M0QW46 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ascl4M0QW46 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ascl4M0QW46 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ascl4M0QW46 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ascl4M0QW46 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ascl4M0QW46 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ascl4M0QW46 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ascl4M0QW46 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ascl4M0QW46 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ascl4M0QW46 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ascl4M0QW46 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ascl4M0QW46 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ascl4M0QW46 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ascl4M0QW46 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ascl4M0QW46 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ascl4M0QW46 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ascl4M0QW46 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ascl4M0QW46 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ascl4M0QW46 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ascl4M0QW46 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ascl4M0QW46 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ascl4M0QW46 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ascl4M0QW46 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ascl4M0QW46 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ascl4M0QW46 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ascl4M0QW46 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ascl4M0QW46 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ascl4M0QW46 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ascl4M0QW46 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ascl4M0QW46 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ascl4M0QW46 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ascl4M0QW46 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ascl4M0QW46 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ascl4M0QW46 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ascl4M0QW46 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ascl4M0QW46 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ascl4M0QW46 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ascl4M0QW46 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ascl4M0QW46 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ascl4M0QW46 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ascl4M0QW46 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ascl4M0QW46 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ascl4M0QW46 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ascl4M0QW46 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ascl4M0QW46 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ascl4M0QW46 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ascl4M0QW46 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ascl4M0QW46 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ascl4M0QW46 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ascl4M0QW46 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ascl4M0QW46 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ascl4M0QW46 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ascl4M0QW46 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ascl4M0QW46 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ascl4M0QW46 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ascl4M0QW46 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ascl4M0QW46 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ascl4M0QW46 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ascl4M0QW46 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ascl4M0QW46 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ascl4M0QW46 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ascl4M0QW46 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ascl4M0QW46 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ascl4M0QW46 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ascl4M0QW46 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ascl4M0QW46 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ascl4M0QW46 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ascl4M0QW46 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ascl4M0QW46 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms