Protein–RNA interactions for Protein: L7N2C4

Gm4340, Predicted gene 4340, mousemouse

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Length 268 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm4340L7N2C4 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Gm4340L7N2C4 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm4340L7N2C4 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm4340L7N2C4 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
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Gm4340L7N2C4 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm4340L7N2C4 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm4340L7N2C4 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm4340L7N2C4 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm4340L7N2C4 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm4340L7N2C4 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm4340L7N2C4 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm4340L7N2C4 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gm4340L7N2C4 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gm4340L7N2C4 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gm4340L7N2C4 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
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Gm4340L7N2C4 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
Gm4340L7N2C4 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gm4340L7N2C4 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gm4340L7N2C4 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gm4340L7N2C4 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm4340L7N2C4 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm4340L7N2C4 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm4340L7N2C4 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm4340L7N2C4 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm4340L7N2C4 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Gm4340L7N2C4 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Gm4340L7N2C4 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Gm4340L7N2C4 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Gm4340L7N2C4 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm4340L7N2C4 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm4340L7N2C4 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm4340L7N2C4 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Gm4340L7N2C4 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Gm4340L7N2C4 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Gm4340L7N2C4 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Gm4340L7N2C4 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Gm4340L7N2C4 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Gm4340L7N2C4 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm4340L7N2C4 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm4340L7N2C4 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm4340L7N2C4 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm4340L7N2C4 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm4340L7N2C4 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm4340L7N2C4 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm4340L7N2C4 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
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Gm4340L7N2C4 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm4340L7N2C4 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm4340L7N2C4 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm4340L7N2C4 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm4340L7N2C4 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm4340L7N2C4 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm4340L7N2C4 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm4340L7N2C4 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm4340L7N2C4 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm4340L7N2C4 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm4340L7N2C4 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm4340L7N2C4 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm4340L7N2C4 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm4340L7N2C4 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm4340L7N2C4 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm4340L7N2C4 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm4340L7N2C4 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm4340L7N2C4 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm4340L7N2C4 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm4340L7N2C4 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm4340L7N2C4 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm4340L7N2C4 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm4340L7N2C4 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
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