Protein–RNA interactions for Protein: L7N216

Speer4d, Spermatogenesis-associated glutamate (E)-rich protein 4D, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4dL7N216 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Speer4dL7N216 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Speer4dL7N216 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Speer4dL7N216 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Speer4dL7N216 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Speer4dL7N216 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Speer4dL7N216 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Speer4dL7N216 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Speer4dL7N216 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Speer4dL7N216 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Speer4dL7N216 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Speer4dL7N216 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Speer4dL7N216 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Speer4dL7N216 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Speer4dL7N216 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Speer4dL7N216 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Speer4dL7N216 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Speer4dL7N216 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Speer4dL7N216 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Speer4dL7N216 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Speer4dL7N216 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Speer4dL7N216 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Speer4dL7N216 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Speer4dL7N216 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Speer4dL7N216 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Speer4dL7N216 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Speer4dL7N216 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Speer4dL7N216 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Speer4dL7N216 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Speer4dL7N216 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Speer4dL7N216 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Speer4dL7N216 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Speer4dL7N216 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Speer4dL7N216 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Speer4dL7N216 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Speer4dL7N216 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Speer4dL7N216 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Speer4dL7N216 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Speer4dL7N216 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Speer4dL7N216 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Speer4dL7N216 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Speer4dL7N216 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Speer4dL7N216 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Speer4dL7N216 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Speer4dL7N216 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Speer4dL7N216 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Speer4dL7N216 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Speer4dL7N216 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Speer4dL7N216 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Speer4dL7N216 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Speer4dL7N216 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Speer4dL7N216 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Speer4dL7N216 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Speer4dL7N216 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Speer4dL7N216 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Speer4dL7N216 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Speer4dL7N216 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Speer4dL7N216 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Speer4dL7N216 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Speer4dL7N216 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Speer4dL7N216 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Speer4dL7N216 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Speer4dL7N216 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Speer4dL7N216 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Speer4dL7N216 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Speer4dL7N216 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Speer4dL7N216 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Speer4dL7N216 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Speer4dL7N216 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Speer4dL7N216 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Speer4dL7N216 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Speer4dL7N216 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Speer4dL7N216 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Speer4dL7N216 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Speer4dL7N216 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Speer4dL7N216 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Speer4dL7N216 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Speer4dL7N216 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Speer4dL7N216 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Speer4dL7N216 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Speer4dL7N216 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Speer4dL7N216 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Speer4dL7N216 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Speer4dL7N216 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Speer4dL7N216 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Speer4dL7N216 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Speer4dL7N216 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Speer4dL7N216 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Speer4dL7N216 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Speer4dL7N216 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Speer4dL7N216 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Speer4dL7N216 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Speer4dL7N216 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Speer4dL7N216 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Speer4dL7N216 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Speer4dL7N216 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Speer4dL7N216 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Speer4dL7N216 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Speer4dL7N216 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Speer4dL7N216 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms