Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm2056J3QQ02 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm2056J3QQ02 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm2056J3QQ02 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm2056J3QQ02 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm2056J3QQ02 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm2056J3QQ02 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm2056J3QQ02 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm2056J3QQ02 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm2056J3QQ02 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm2056J3QQ02 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm2056J3QQ02 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm2056J3QQ02 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm2056J3QQ02 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm2056J3QQ02 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm2056J3QQ02 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm2056J3QQ02 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm2056J3QQ02 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm2056J3QQ02 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm2056J3QQ02 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm2056J3QQ02 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm2056J3QQ02 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm2056J3QQ02 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm2056J3QQ02 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm2056J3QQ02 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm2056J3QQ02 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm2056J3QQ02 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm2056J3QQ02 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm2056J3QQ02 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm2056J3QQ02 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm2056J3QQ02 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm2056J3QQ02 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm2056J3QQ02 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm2056J3QQ02 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm2056J3QQ02 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm2056J3QQ02 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm2056J3QQ02 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm2056J3QQ02 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm2056J3QQ02 Gm43377-201ENSMUST00000201640 455 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm2056J3QQ02 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm2056J3QQ02 AC155266.1-201ENSMUST00000220762 904 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm2056J3QQ02 AC102569.1-204ENSMUST00000222816 793 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm2056J3QQ02 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm2056J3QQ02 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm2056J3QQ02 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm2056J3QQ02 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm2056J3QQ02 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm2056J3QQ02 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm2056J3QQ02 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm2056J3QQ02 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm2056J3QQ02 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm2056J3QQ02 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm2056J3QQ02 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm2056J3QQ02 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm2056J3QQ02 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm2056J3QQ02 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm2056J3QQ02 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm2056J3QQ02 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm2056J3QQ02 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm2056J3QQ02 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm2056J3QQ02 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm2056J3QQ02 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm2056J3QQ02 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm2056J3QQ02 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm2056J3QQ02 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm2056J3QQ02 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm2056J3QQ02 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm2056J3QQ02 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm2056J3QQ02 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm2056J3QQ02 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm2056J3QQ02 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm2056J3QQ02 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm2056J3QQ02 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm2056J3QQ02 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm2056J3QQ02 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm2056J3QQ02 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm2056J3QQ02 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm2056J3QQ02 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm2056J3QQ02 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm2056J3QQ02 Gm28975-201ENSMUST00000186412 686 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm2056J3QQ02 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm2056J3QQ02 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm2056J3QQ02 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm2056J3QQ02 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm2056J3QQ02 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm2056J3QQ02 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm2056J3QQ02 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm2056J3QQ02 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm2056J3QQ02 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm2056J3QQ02 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm2056J3QQ02 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm2056J3QQ02 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm2056J3QQ02 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm2056J3QQ02 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm2056J3QQ02 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm2056J3QQ02 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm2056J3QQ02 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm2056J3QQ02 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm2056J3QQ02 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm2056J3QQ02 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.7 ms