Protein–RNA interactions for Protein: J3QMY9

Top6bl, Type 2 DNA topoisomerase 6 subunit B-like, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top6blJ3QMY9 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Top6blJ3QMY9 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Top6blJ3QMY9 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Top6blJ3QMY9 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Top6blJ3QMY9 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Top6blJ3QMY9 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Top6blJ3QMY9 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Top6blJ3QMY9 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Top6blJ3QMY9 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Top6blJ3QMY9 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Top6blJ3QMY9 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Top6blJ3QMY9 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Top6blJ3QMY9 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Top6blJ3QMY9 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Top6blJ3QMY9 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Top6blJ3QMY9 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Top6blJ3QMY9 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Top6blJ3QMY9 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Top6blJ3QMY9 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Top6blJ3QMY9 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Top6blJ3QMY9 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Top6blJ3QMY9 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Top6blJ3QMY9 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Top6blJ3QMY9 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Top6blJ3QMY9 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Top6blJ3QMY9 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Top6blJ3QMY9 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Top6blJ3QMY9 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Top6blJ3QMY9 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Top6blJ3QMY9 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Top6blJ3QMY9 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Top6blJ3QMY9 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Top6blJ3QMY9 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Top6blJ3QMY9 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Top6blJ3QMY9 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Top6blJ3QMY9 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Top6blJ3QMY9 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Top6blJ3QMY9 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Top6blJ3QMY9 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Top6blJ3QMY9 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Top6blJ3QMY9 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Top6blJ3QMY9 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Top6blJ3QMY9 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Top6blJ3QMY9 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Top6blJ3QMY9 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Top6blJ3QMY9 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Top6blJ3QMY9 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Top6blJ3QMY9 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Top6blJ3QMY9 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Top6blJ3QMY9 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Top6blJ3QMY9 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Top6blJ3QMY9 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Top6blJ3QMY9 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Top6blJ3QMY9 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Top6blJ3QMY9 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Top6blJ3QMY9 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Top6blJ3QMY9 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Top6blJ3QMY9 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Top6blJ3QMY9 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Top6blJ3QMY9 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Top6blJ3QMY9 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Top6blJ3QMY9 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Top6blJ3QMY9 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Top6blJ3QMY9 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Top6blJ3QMY9 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Top6blJ3QMY9 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Top6blJ3QMY9 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Top6blJ3QMY9 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Top6blJ3QMY9 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Top6blJ3QMY9 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Top6blJ3QMY9 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Top6blJ3QMY9 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Top6blJ3QMY9 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Top6blJ3QMY9 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Top6blJ3QMY9 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Top6blJ3QMY9 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Top6blJ3QMY9 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Top6blJ3QMY9 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Top6blJ3QMY9 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Top6blJ3QMY9 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Top6blJ3QMY9 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Top6blJ3QMY9 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Top6blJ3QMY9 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Top6blJ3QMY9 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Top6blJ3QMY9 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Top6blJ3QMY9 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Top6blJ3QMY9 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Top6blJ3QMY9 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Top6blJ3QMY9 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Top6blJ3QMY9 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Top6blJ3QMY9 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Top6blJ3QMY9 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Top6blJ3QMY9 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.4 ms