Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS8

Gm3415, Predicted gene 3415, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3415J3QMS8 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm3415J3QMS8 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm3415J3QMS8 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm3415J3QMS8 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm3415J3QMS8 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm3415J3QMS8 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm3415J3QMS8 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm3415J3QMS8 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm3415J3QMS8 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm3415J3QMS8 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm3415J3QMS8 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm3415J3QMS8 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm3415J3QMS8 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm3415J3QMS8 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm3415J3QMS8 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm3415J3QMS8 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm3415J3QMS8 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm3415J3QMS8 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm3415J3QMS8 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm3415J3QMS8 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm3415J3QMS8 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm3415J3QMS8 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm3415J3QMS8 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm3415J3QMS8 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm3415J3QMS8 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm3415J3QMS8 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm3415J3QMS8 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm3415J3QMS8 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm3415J3QMS8 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm3415J3QMS8 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm3415J3QMS8 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm3415J3QMS8 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm3415J3QMS8 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm3415J3QMS8 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm3415J3QMS8 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm3415J3QMS8 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm3415J3QMS8 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm3415J3QMS8 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm3415J3QMS8 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm3415J3QMS8 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm3415J3QMS8 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm3415J3QMS8 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm3415J3QMS8 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm3415J3QMS8 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm3415J3QMS8 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm3415J3QMS8 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm3415J3QMS8 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm3415J3QMS8 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm3415J3QMS8 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm3415J3QMS8 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm3415J3QMS8 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm3415J3QMS8 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm3415J3QMS8 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm3415J3QMS8 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm3415J3QMS8 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm3415J3QMS8 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3415J3QMS8 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3415J3QMS8 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3415J3QMS8 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3415J3QMS8 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3415J3QMS8 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3415J3QMS8 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3415J3QMS8 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3415J3QMS8 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3415J3QMS8 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3415J3QMS8 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3415J3QMS8 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3415J3QMS8 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3415J3QMS8 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3415J3QMS8 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3415J3QMS8 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3415J3QMS8 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3415J3QMS8 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3415J3QMS8 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3415J3QMS8 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3415J3QMS8 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3415J3QMS8 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3415J3QMS8 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3415J3QMS8 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3415J3QMS8 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3415J3QMS8 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3415J3QMS8 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3415J3QMS8 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3415J3QMS8 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3415J3QMS8 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3415J3QMS8 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3415J3QMS8 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3415J3QMS8 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3415J3QMS8 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3415J3QMS8 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3415J3QMS8 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3415J3QMS8 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3415J3QMS8 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3415J3QMS8 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3415J3QMS8 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3415J3QMS8 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3415J3QMS8 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3415J3QMS8 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm3415J3QMS8 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm3415J3QMS8 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms