Protein–RNA interactions for Protein: J3KMU4

Gm21060, Predicted gene, 21060, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21060J3KMU4 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Gm21060J3KMU4 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Gm21060J3KMU4 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Gm21060J3KMU4 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Gm21060J3KMU4 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Gm21060J3KMU4 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Gm21060J3KMU4 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Gm21060J3KMU4 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Gm21060J3KMU4 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Gm21060J3KMU4 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Gm21060J3KMU4 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Gm21060J3KMU4 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Gm21060J3KMU4 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Gm21060J3KMU4 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Gm21060J3KMU4 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Gm21060J3KMU4 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Gm21060J3KMU4 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Gm21060J3KMU4 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Gm21060J3KMU4 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm21060J3KMU4 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm21060J3KMU4 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm21060J3KMU4 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm21060J3KMU4 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm21060J3KMU4 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm21060J3KMU4 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm21060J3KMU4 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm21060J3KMU4 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm21060J3KMU4 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm21060J3KMU4 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm21060J3KMU4 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm21060J3KMU4 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm21060J3KMU4 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm21060J3KMU4 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm21060J3KMU4 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm21060J3KMU4 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm21060J3KMU4 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm21060J3KMU4 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm21060J3KMU4 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm21060J3KMU4 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm21060J3KMU4 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm21060J3KMU4 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm21060J3KMU4 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm21060J3KMU4 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm21060J3KMU4 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm21060J3KMU4 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm21060J3KMU4 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm21060J3KMU4 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm21060J3KMU4 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm21060J3KMU4 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm21060J3KMU4 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm21060J3KMU4 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm21060J3KMU4 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm21060J3KMU4 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm21060J3KMU4 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm21060J3KMU4 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm21060J3KMU4 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm21060J3KMU4 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm21060J3KMU4 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm21060J3KMU4 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm21060J3KMU4 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm21060J3KMU4 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm21060J3KMU4 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm21060J3KMU4 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm21060J3KMU4 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm21060J3KMU4 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm21060J3KMU4 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm21060J3KMU4 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm21060J3KMU4 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm21060J3KMU4 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm21060J3KMU4 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm21060J3KMU4 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm21060J3KMU4 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm21060J3KMU4 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm21060J3KMU4 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm21060J3KMU4 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm21060J3KMU4 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm21060J3KMU4 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm21060J3KMU4 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm21060J3KMU4 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm21060J3KMU4 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm21060J3KMU4 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm21060J3KMU4 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm21060J3KMU4 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm21060J3KMU4 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm21060J3KMU4 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm21060J3KMU4 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm21060J3KMU4 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm21060J3KMU4 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm21060J3KMU4 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm21060J3KMU4 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm21060J3KMU4 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm21060J3KMU4 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm21060J3KMU4 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm21060J3KMU4 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm21060J3KMU4 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm21060J3KMU4 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm21060J3KMU4 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm21060J3KMU4 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm21060J3KMU4 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm21060J3KMU4 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
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