Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS6

Gm21818, MCG122238, isoform CRA_a, mousemouse

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Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21818J3KMS6 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm21818J3KMS6 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm21818J3KMS6 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm21818J3KMS6 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm21818J3KMS6 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm21818J3KMS6 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm21818J3KMS6 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm21818J3KMS6 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm21818J3KMS6 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm21818J3KMS6 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm21818J3KMS6 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm21818J3KMS6 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm21818J3KMS6 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm21818J3KMS6 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm21818J3KMS6 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm21818J3KMS6 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm21818J3KMS6 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm21818J3KMS6 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm21818J3KMS6 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm21818J3KMS6 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm21818J3KMS6 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm21818J3KMS6 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm21818J3KMS6 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm21818J3KMS6 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm21818J3KMS6 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm21818J3KMS6 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm21818J3KMS6 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm21818J3KMS6 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm21818J3KMS6 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm21818J3KMS6 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm21818J3KMS6 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm21818J3KMS6 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm21818J3KMS6 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm21818J3KMS6 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm21818J3KMS6 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm21818J3KMS6 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm21818J3KMS6 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm21818J3KMS6 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm21818J3KMS6 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm21818J3KMS6 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm21818J3KMS6 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm21818J3KMS6 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm21818J3KMS6 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm21818J3KMS6 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm21818J3KMS6 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm21818J3KMS6 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm21818J3KMS6 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm21818J3KMS6 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm21818J3KMS6 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm21818J3KMS6 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm21818J3KMS6 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm21818J3KMS6 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm21818J3KMS6 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm21818J3KMS6 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm21818J3KMS6 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm21818J3KMS6 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm21818J3KMS6 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm21818J3KMS6 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm21818J3KMS6 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm21818J3KMS6 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm21818J3KMS6 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm21818J3KMS6 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm21818J3KMS6 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm21818J3KMS6 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm21818J3KMS6 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm21818J3KMS6 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm21818J3KMS6 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm21818J3KMS6 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm21818J3KMS6 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
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Gm21818J3KMS6 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm21818J3KMS6 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm21818J3KMS6 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm21818J3KMS6 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm21818J3KMS6 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm21818J3KMS6 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm21818J3KMS6 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm21818J3KMS6 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm21818J3KMS6 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm21818J3KMS6 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm21818J3KMS6 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm21818J3KMS6 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm21818J3KMS6 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm21818J3KMS6 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm21818J3KMS6 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm21818J3KMS6 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm21818J3KMS6 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm21818J3KMS6 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm21818J3KMS6 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm21818J3KMS6 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm21818J3KMS6 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm21818J3KMS6 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm21818J3KMS6 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm21818J3KMS6 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm21818J3KMS6 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm21818J3KMS6 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm21818J3KMS6 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm21818J3KMS6 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm21818J3KMS6 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
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