Protein–RNA interactions for Protein: J3KMI7

Gm20828, MCG116667, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20828J3KMI7 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20828J3KMI7 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20828J3KMI7 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20828J3KMI7 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20828J3KMI7 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20828J3KMI7 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20828J3KMI7 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20828J3KMI7 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20828J3KMI7 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20828J3KMI7 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20828J3KMI7 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20828J3KMI7 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20828J3KMI7 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20828J3KMI7 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20828J3KMI7 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20828J3KMI7 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20828J3KMI7 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20828J3KMI7 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20828J3KMI7 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20828J3KMI7 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20828J3KMI7 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20828J3KMI7 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20828J3KMI7 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20828J3KMI7 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20828J3KMI7 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20828J3KMI7 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20828J3KMI7 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20828J3KMI7 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20828J3KMI7 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20828J3KMI7 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
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Gm20828J3KMI7 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20828J3KMI7 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20828J3KMI7 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20828J3KMI7 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20828J3KMI7 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20828J3KMI7 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20828J3KMI7 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20828J3KMI7 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20828J3KMI7 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20828J3KMI7 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20828J3KMI7 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20828J3KMI7 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20828J3KMI7 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20828J3KMI7 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20828J3KMI7 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20828J3KMI7 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20828J3KMI7 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20828J3KMI7 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20828J3KMI7 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20828J3KMI7 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20828J3KMI7 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20828J3KMI7 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20828J3KMI7 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20828J3KMI7 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20828J3KMI7 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20828J3KMI7 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20828J3KMI7 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20828J3KMI7 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20828J3KMI7 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20828J3KMI7 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20828J3KMI7 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20828J3KMI7 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20828J3KMI7 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
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Gm20828J3KMI7 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20828J3KMI7 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20828J3KMI7 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20828J3KMI7 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20828J3KMI7 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20828J3KMI7 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20828J3KMI7 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20828J3KMI7 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20828J3KMI7 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20828J3KMI7 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20828J3KMI7 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20828J3KMI7 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20828J3KMI7 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20828J3KMI7 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20828J3KMI7 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20828J3KMI7 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20828J3KMI7 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20828J3KMI7 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20828J3KMI7 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20828J3KMI7 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20828J3KMI7 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20828J3KMI7 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20828J3KMI7 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20828J3KMI7 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm20828J3KMI7 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm20828J3KMI7 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm20828J3KMI7 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm20828J3KMI7 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm20828J3KMI7 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
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