Protein–RNA interactions for Protein: F6RGI3

Gm340, Predicted gene 340, mousemouse

Predictions only

Length 1,242 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm340F6RGI3 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm340F6RGI3 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm340F6RGI3 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm340F6RGI3 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm340F6RGI3 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm340F6RGI3 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm340F6RGI3 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm340F6RGI3 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm340F6RGI3 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm340F6RGI3 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm340F6RGI3 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm340F6RGI3 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm340F6RGI3 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm340F6RGI3 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm340F6RGI3 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm340F6RGI3 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm340F6RGI3 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm340F6RGI3 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm340F6RGI3 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm340F6RGI3 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm340F6RGI3 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm340F6RGI3 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm340F6RGI3 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm340F6RGI3 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm340F6RGI3 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm340F6RGI3 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm340F6RGI3 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm340F6RGI3 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm340F6RGI3 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm340F6RGI3 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm340F6RGI3 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm340F6RGI3 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm340F6RGI3 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm340F6RGI3 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm340F6RGI3 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm340F6RGI3 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm340F6RGI3 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm340F6RGI3 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm340F6RGI3 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm340F6RGI3 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm340F6RGI3 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm340F6RGI3 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm340F6RGI3 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm340F6RGI3 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm340F6RGI3 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm340F6RGI3 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm340F6RGI3 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm340F6RGI3 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm340F6RGI3 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm340F6RGI3 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm340F6RGI3 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm340F6RGI3 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm340F6RGI3 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm340F6RGI3 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm340F6RGI3 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm340F6RGI3 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm340F6RGI3 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm340F6RGI3 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm340F6RGI3 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm340F6RGI3 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm340F6RGI3 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm340F6RGI3 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm340F6RGI3 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm340F6RGI3 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm340F6RGI3 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm340F6RGI3 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm340F6RGI3 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm340F6RGI3 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm340F6RGI3 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm340F6RGI3 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm340F6RGI3 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm340F6RGI3 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm340F6RGI3 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm340F6RGI3 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm340F6RGI3 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm340F6RGI3 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm340F6RGI3 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm340F6RGI3 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm340F6RGI3 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm340F6RGI3 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm340F6RGI3 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm340F6RGI3 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm340F6RGI3 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm340F6RGI3 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm340F6RGI3 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm340F6RGI3 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm340F6RGI3 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm340F6RGI3 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm340F6RGI3 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm340F6RGI3 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm340F6RGI3 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm340F6RGI3 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm340F6RGI3 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm340F6RGI3 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm340F6RGI3 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm340F6RGI3 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm340F6RGI3 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm340F6RGI3 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm340F6RGI3 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm340F6RGI3 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
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