Protein–RNA interactions for Protein: E9QA62

Lmod3, Leiomodin-3, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod3E9QA62 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lmod3E9QA62 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Lmod3E9QA62 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Lmod3E9QA62 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Lmod3E9QA62 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Lmod3E9QA62 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Lmod3E9QA62 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lmod3E9QA62 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lmod3E9QA62 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lmod3E9QA62 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Lmod3E9QA62 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lmod3E9QA62 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lmod3E9QA62 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Lmod3E9QA62 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lmod3E9QA62 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lmod3E9QA62 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lmod3E9QA62 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lmod3E9QA62 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lmod3E9QA62 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lmod3E9QA62 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lmod3E9QA62 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lmod3E9QA62 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lmod3E9QA62 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lmod3E9QA62 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lmod3E9QA62 Hspa5-201ENSMUST00000028222 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lmod3E9QA62 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lmod3E9QA62 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lmod3E9QA62 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lmod3E9QA62 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lmod3E9QA62 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Lmod3E9QA62 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lmod3E9QA62 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lmod3E9QA62 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lmod3E9QA62 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lmod3E9QA62 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lmod3E9QA62 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lmod3E9QA62 Pcnt-201ENSMUST00000001179 9331 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lmod3E9QA62 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Lmod3E9QA62 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lmod3E9QA62 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lmod3E9QA62 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lmod3E9QA62 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lmod3E9QA62 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lmod3E9QA62 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lmod3E9QA62 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Lmod3E9QA62 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lmod3E9QA62 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lmod3E9QA62 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lmod3E9QA62 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lmod3E9QA62 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Lmod3E9QA62 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lmod3E9QA62 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Lmod3E9QA62 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Lmod3E9QA62 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Lmod3E9QA62 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lmod3E9QA62 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lmod3E9QA62 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Lmod3E9QA62 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lmod3E9QA62 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lmod3E9QA62 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lmod3E9QA62 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lmod3E9QA62 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lmod3E9QA62 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lmod3E9QA62 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lmod3E9QA62 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lmod3E9QA62 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lmod3E9QA62 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lmod3E9QA62 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lmod3E9QA62 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lmod3E9QA62 Cln8-201ENSMUST00000027554 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lmod3E9QA62 Plcd4-205ENSMUST00000113749 4648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lmod3E9QA62 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lmod3E9QA62 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lmod3E9QA62 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lmod3E9QA62 Stx1b-201ENSMUST00000106267 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lmod3E9QA62 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lmod3E9QA62 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lmod3E9QA62 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lmod3E9QA62 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lmod3E9QA62 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lmod3E9QA62 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lmod3E9QA62 Olfr46-203ENSMUST00000214180 7750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lmod3E9QA62 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lmod3E9QA62 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lmod3E9QA62 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lmod3E9QA62 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lmod3E9QA62 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lmod3E9QA62 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Lmod3E9QA62 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Lmod3E9QA62 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lmod3E9QA62 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lmod3E9QA62 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lmod3E9QA62 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lmod3E9QA62 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lmod3E9QA62 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lmod3E9QA62 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lmod3E9QA62 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lmod3E9QA62 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Lmod3E9QA62 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lmod3E9QA62 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms