Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ1

Ddx60, DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 60, mousemouse

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Length 1,711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx60E9PZQ1 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ddx60E9PZQ1 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ddx60E9PZQ1 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ddx60E9PZQ1 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ddx60E9PZQ1 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ddx60E9PZQ1 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ddx60E9PZQ1 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ddx60E9PZQ1 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ddx60E9PZQ1 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ddx60E9PZQ1 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ddx60E9PZQ1 Gm16166-201ENSMUST00000118291 787 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ddx60E9PZQ1 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ddx60E9PZQ1 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ddx60E9PZQ1 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ddx60E9PZQ1 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ddx60E9PZQ1 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ddx60E9PZQ1 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ddx60E9PZQ1 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ddx60E9PZQ1 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ddx60E9PZQ1 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ddx60E9PZQ1 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ddx60E9PZQ1 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ddx60E9PZQ1 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ddx60E9PZQ1 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ddx60E9PZQ1 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ddx60E9PZQ1 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ddx60E9PZQ1 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ddx60E9PZQ1 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ddx60E9PZQ1 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ddx60E9PZQ1 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ddx60E9PZQ1 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ddx60E9PZQ1 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ddx60E9PZQ1 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ddx60E9PZQ1 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ddx60E9PZQ1 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Ddx60E9PZQ1 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ddx60E9PZQ1 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
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Ddx60E9PZQ1 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ddx60E9PZQ1 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ddx60E9PZQ1 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ddx60E9PZQ1 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ddx60E9PZQ1 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ddx60E9PZQ1 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ddx60E9PZQ1 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ddx60E9PZQ1 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ddx60E9PZQ1 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ddx60E9PZQ1 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ddx60E9PZQ1 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ddx60E9PZQ1 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ddx60E9PZQ1 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ddx60E9PZQ1 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ddx60E9PZQ1 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ddx60E9PZQ1 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Ddx60E9PZQ1 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ddx60E9PZQ1 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ddx60E9PZQ1 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ddx60E9PZQ1 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Ddx60E9PZQ1 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ddx60E9PZQ1 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Ddx60E9PZQ1 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Ddx60E9PZQ1 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ddx60E9PZQ1 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ddx60E9PZQ1 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ddx60E9PZQ1 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ddx60E9PZQ1 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ddx60E9PZQ1 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ddx60E9PZQ1 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ddx60E9PZQ1 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ddx60E9PZQ1 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ddx60E9PZQ1 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ddx60E9PZQ1 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ddx60E9PZQ1 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ddx60E9PZQ1 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ddx60E9PZQ1 Gm44980-201ENSMUST00000205826 314 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ddx60E9PZQ1 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ddx60E9PZQ1 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ddx60E9PZQ1 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ddx60E9PZQ1 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.3 ms