Protein–RNA interactions for Protein: E9PXC0

Srp54b, Signal recognition particle 54 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp54bE9PXC0 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Srp54bE9PXC0 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Srp54bE9PXC0 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Srp54bE9PXC0 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Srp54bE9PXC0 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Srp54bE9PXC0 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Srp54bE9PXC0 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Srp54bE9PXC0 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Srp54bE9PXC0 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Srp54bE9PXC0 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Srp54bE9PXC0 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Srp54bE9PXC0 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Srp54bE9PXC0 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Srp54bE9PXC0 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Srp54bE9PXC0 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Srp54bE9PXC0 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Srp54bE9PXC0 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Srp54bE9PXC0 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Srp54bE9PXC0 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Srp54bE9PXC0 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Srp54bE9PXC0 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Srp54bE9PXC0 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Srp54bE9PXC0 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Srp54bE9PXC0 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Srp54bE9PXC0 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Srp54bE9PXC0 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Srp54bE9PXC0 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Srp54bE9PXC0 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Srp54bE9PXC0 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Srp54bE9PXC0 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Srp54bE9PXC0 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Srp54bE9PXC0 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Srp54bE9PXC0 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Srp54bE9PXC0 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Srp54bE9PXC0 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Srp54bE9PXC0 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Srp54bE9PXC0 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Srp54bE9PXC0 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Srp54bE9PXC0 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Srp54bE9PXC0 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Srp54bE9PXC0 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Srp54bE9PXC0 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Srp54bE9PXC0 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Srp54bE9PXC0 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Srp54bE9PXC0 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Srp54bE9PXC0 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Srp54bE9PXC0 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Srp54bE9PXC0 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Srp54bE9PXC0 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Srp54bE9PXC0 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Srp54bE9PXC0 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Srp54bE9PXC0 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Srp54bE9PXC0 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Srp54bE9PXC0 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Srp54bE9PXC0 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Srp54bE9PXC0 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Srp54bE9PXC0 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Srp54bE9PXC0 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Srp54bE9PXC0 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Srp54bE9PXC0 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Srp54bE9PXC0 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Srp54bE9PXC0 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Srp54bE9PXC0 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Srp54bE9PXC0 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Srp54bE9PXC0 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Srp54bE9PXC0 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Srp54bE9PXC0 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Srp54bE9PXC0 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Srp54bE9PXC0 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Srp54bE9PXC0 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Srp54bE9PXC0 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Srp54bE9PXC0 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Srp54bE9PXC0 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Srp54bE9PXC0 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Srp54bE9PXC0 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Srp54bE9PXC0 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Srp54bE9PXC0 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Srp54bE9PXC0 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Srp54bE9PXC0 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Srp54bE9PXC0 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Srp54bE9PXC0 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Srp54bE9PXC0 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Srp54bE9PXC0 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Srp54bE9PXC0 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Srp54bE9PXC0 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Srp54bE9PXC0 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Srp54bE9PXC0 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Srp54bE9PXC0 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Srp54bE9PXC0 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Srp54bE9PXC0 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Srp54bE9PXC0 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Srp54bE9PXC0 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Srp54bE9PXC0 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Srp54bE9PXC0 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Srp54bE9PXC0 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Srp54bE9PXC0 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Srp54bE9PXC0 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Srp54bE9PXC0 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Srp54bE9PXC0 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Srp54bE9PXC0 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms