Protein–RNA interactions for Protein: E9PWG2

Trappc8, Trafficking protein particle complex 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc8E9PWG2 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trappc8E9PWG2 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trappc8E9PWG2 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trappc8E9PWG2 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trappc8E9PWG2 Gm12990-201ENSMUST00000120372 468 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Trappc8E9PWG2 Gm12516-201ENSMUST00000120819 385 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Trappc8E9PWG2 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trappc8E9PWG2 Gm15978-201ENSMUST00000161043 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trappc8E9PWG2 1700025F24Rik-201ENSMUST00000185238 894 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trappc8E9PWG2 Gm42518-201ENSMUST00000196277 938 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Trappc8E9PWG2 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trappc8E9PWG2 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trappc8E9PWG2 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trappc8E9PWG2 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trappc8E9PWG2 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trappc8E9PWG2 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trappc8E9PWG2 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trappc8E9PWG2 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trappc8E9PWG2 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trappc8E9PWG2 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trappc8E9PWG2 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trappc8E9PWG2 Rtn2-202ENSMUST00000108468 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trappc8E9PWG2 Gm13182-201ENSMUST00000122241 312 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Trappc8E9PWG2 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Trappc8E9PWG2 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trappc8E9PWG2 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trappc8E9PWG2 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trappc8E9PWG2 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trappc8E9PWG2 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trappc8E9PWG2 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trappc8E9PWG2 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trappc8E9PWG2 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Trappc8E9PWG2 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trappc8E9PWG2 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Trappc8E9PWG2 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trappc8E9PWG2 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trappc8E9PWG2 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trappc8E9PWG2 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trappc8E9PWG2 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trappc8E9PWG2 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trappc8E9PWG2 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trappc8E9PWG2 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trappc8E9PWG2 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trappc8E9PWG2 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trappc8E9PWG2 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trappc8E9PWG2 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trappc8E9PWG2 Arl6ip5-201ENSMUST00000044681 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trappc8E9PWG2 Akr1b10-202ENSMUST00000115051 1022 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trappc8E9PWG2 Gm15619-201ENSMUST00000128415 1294 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trappc8E9PWG2 Gm15764-201ENSMUST00000150389 672 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trappc8E9PWG2 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trappc8E9PWG2 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trappc8E9PWG2 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trappc8E9PWG2 AC165260.2-203ENSMUST00000224237 336 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Trappc8E9PWG2 AC154176.1-201ENSMUST00000225897 220 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Trappc8E9PWG2 Commd4-201ENSMUST00000065358 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trappc8E9PWG2 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trappc8E9PWG2 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trappc8E9PWG2 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trappc8E9PWG2 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trappc8E9PWG2 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trappc8E9PWG2 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trappc8E9PWG2 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trappc8E9PWG2 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trappc8E9PWG2 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trappc8E9PWG2 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trappc8E9PWG2 Gm12628-201ENSMUST00000122193 382 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Trappc8E9PWG2 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trappc8E9PWG2 Gm37800-202ENSMUST00000193667 553 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trappc8E9PWG2 Mrpl23-206ENSMUST00000210662 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trappc8E9PWG2 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trappc8E9PWG2 Gm3285-201ENSMUST00000218443 908 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trappc8E9PWG2 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trappc8E9PWG2 Tbca-201ENSMUST00000046644 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trappc8E9PWG2 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trappc8E9PWG2 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trappc8E9PWG2 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trappc8E9PWG2 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trappc8E9PWG2 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trappc8E9PWG2 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trappc8E9PWG2 Tmem62-202ENSMUST00000110686 2417 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trappc8E9PWG2 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trappc8E9PWG2 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trappc8E9PWG2 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trappc8E9PWG2 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trappc8E9PWG2 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trappc8E9PWG2 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trappc8E9PWG2 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trappc8E9PWG2 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trappc8E9PWG2 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Trappc8E9PWG2 Rabggtb-202ENSMUST00000167111 1418 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trappc8E9PWG2 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Trappc8E9PWG2 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Trappc8E9PWG2 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trappc8E9PWG2 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Trappc8E9PWG2 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trappc8E9PWG2 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Trappc8E9PWG2 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Trappc8E9PWG2 Ifna2-201ENSMUST00000105147 1032 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Trappc8E9PWG2 Igf1-205ENSMUST00000121952 798 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms