Protein–RNA interactions for Protein: D3YZZ2

Tgfbr3l, Transforming growth factor, beta receptor III-like, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfbr3lD3YZZ2 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Tgfbr3lD3YZZ2 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tgfbr3lD3YZZ2 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Tgfbr3lD3YZZ2 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tgfbr3lD3YZZ2 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tgfbr3lD3YZZ2 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.43
Tgfbr3lD3YZZ2 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Tgfbr3lD3YZZ2 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Tgfbr3lD3YZZ2 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Tgfbr3lD3YZZ2 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Tgfbr3lD3YZZ2 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Tgfbr3lD3YZZ2 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tgfbr3lD3YZZ2 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tgfbr3lD3YZZ2 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tgfbr3lD3YZZ2 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Tgfbr3lD3YZZ2 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tgfbr3lD3YZZ2 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tgfbr3lD3YZZ2 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tgfbr3lD3YZZ2 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tgfbr3lD3YZZ2 Agbl3-201ENSMUST00000115009 806 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Tgfbr3lD3YZZ2 Smim1-206ENSMUST00000132541 490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tgfbr3lD3YZZ2 Nop16-202ENSMUST00000148222 790 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm6408-201ENSMUST00000179032 1171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm44421-201ENSMUST00000205064 1221 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Tgfbr3lD3YZZ2 Fabp6-201ENSMUST00000020672 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tgfbr3lD3YZZ2 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tgfbr3lD3YZZ2 6430531B16Rik-204ENSMUST00000209335 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm45338-204ENSMUST00000210658 1105 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tgfbr3lD3YZZ2 1700012D14Rik-204ENSMUST00000210788 547 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm2875-201ENSMUST00000211333 360 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Tgfbr3lD3YZZ2 AC124433.1-201ENSMUST00000224483 1063 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Tgfbr3lD3YZZ2 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tgfbr3lD3YZZ2 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tgfbr3lD3YZZ2 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tgfbr3lD3YZZ2 Sln-201ENSMUST00000048485 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tgfbr3lD3YZZ2 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tgfbr3lD3YZZ2 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tgfbr3lD3YZZ2 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tgfbr3lD3YZZ2 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tgfbr3lD3YZZ2 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tgfbr3lD3YZZ2 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tgfbr3lD3YZZ2 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tgfbr3lD3YZZ2 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tgfbr3lD3YZZ2 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tgfbr3lD3YZZ2 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tgfbr3lD3YZZ2 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tgfbr3lD3YZZ2 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm7278-201ENSMUST00000119836 1401 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Tgfbr3lD3YZZ2 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tgfbr3lD3YZZ2 Krtap4-6-201ENSMUST00000100476 918 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Tgfbr3lD3YZZ2 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm17877-201ENSMUST00000192578 814 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Tgfbr3lD3YZZ2 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Tgfbr3lD3YZZ2 Smco2-201ENSMUST00000032433 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tgfbr3lD3YZZ2 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Tgfbr3lD3YZZ2 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tgfbr3lD3YZZ2 mt-Rnr1-201ENSMUST00000082388 955 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tgfbr3lD3YZZ2 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tgfbr3lD3YZZ2 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tgfbr3lD3YZZ2 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tgfbr3lD3YZZ2 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tgfbr3lD3YZZ2 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tgfbr3lD3YZZ2 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tgfbr3lD3YZZ2 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tgfbr3lD3YZZ2 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tgfbr3lD3YZZ2 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tgfbr3lD3YZZ2 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tgfbr3lD3YZZ2 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tgfbr3lD3YZZ2 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tgfbr3lD3YZZ2 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tgfbr3lD3YZZ2 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tgfbr3lD3YZZ2 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tgfbr3lD3YZZ2 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tgfbr3lD3YZZ2 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tgfbr3lD3YZZ2 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tgfbr3lD3YZZ2 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tgfbr3lD3YZZ2 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tgfbr3lD3YZZ2 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tgfbr3lD3YZZ2 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tgfbr3lD3YZZ2 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tgfbr3lD3YZZ2 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tgfbr3lD3YZZ2 Ighv10-1-201ENSMUST00000103492 359 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Tgfbr3lD3YZZ2 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm12816-201ENSMUST00000118069 1212 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm16071-201ENSMUST00000119589 793 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Tgfbr3lD3YZZ2 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms