Protein–RNA interactions for Protein: D3YZP9

Ccdc6, Coiled-coil domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc6D3YZP9 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc6D3YZP9 Poc1a-209ENSMUST00000216228 1431 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc6D3YZP9 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc6D3YZP9 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc6D3YZP9 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc6D3YZP9 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc6D3YZP9 Art5-202ENSMUST00000106934 843 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc6D3YZP9 Rbfox1-202ENSMUST00000115841 1191 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc6D3YZP9 Eef1d-207ENSMUST00000116440 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc6D3YZP9 Ice2-202ENSMUST00000117246 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc6D3YZP9 Gm17070-201ENSMUST00000170463 784 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc6D3YZP9 Olfr755-ps1-201ENSMUST00000173568 910 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc6D3YZP9 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc6D3YZP9 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc6D3YZP9 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc6D3YZP9 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc6D3YZP9 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc6D3YZP9 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc6D3YZP9 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc6D3YZP9 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc6D3YZP9 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc6D3YZP9 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc6D3YZP9 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc6D3YZP9 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc6D3YZP9 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc6D3YZP9 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc6D3YZP9 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc6D3YZP9 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc6D3YZP9 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc6D3YZP9 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc6D3YZP9 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc6D3YZP9 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc6D3YZP9 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc6D3YZP9 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc6D3YZP9 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc6D3YZP9 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc6D3YZP9 Gm14213-201ENSMUST00000119778 768 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc6D3YZP9 Gm38389-201ENSMUST00000147871 653 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc6D3YZP9 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc6D3YZP9 Mir99ahg-209ENSMUST00000182820 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc6D3YZP9 Mir6941-201ENSMUST00000184711 59 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc6D3YZP9 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc6D3YZP9 Mrpl30-207ENSMUST00000195373 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc6D3YZP9 Gm17590-202ENSMUST00000197881 1232 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc6D3YZP9 4933430L12Rik-201ENSMUST00000206788 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc6D3YZP9 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc6D3YZP9 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc6D3YZP9 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc6D3YZP9 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc6D3YZP9 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc6D3YZP9 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc6D3YZP9 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc6D3YZP9 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc6D3YZP9 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc6D3YZP9 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc6D3YZP9 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc6D3YZP9 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc6D3YZP9 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc6D3YZP9 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc6D3YZP9 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc6D3YZP9 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc6D3YZP9 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc6D3YZP9 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc6D3YZP9 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc6D3YZP9 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc6D3YZP9 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc6D3YZP9 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc6D3YZP9 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc6D3YZP9 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc6D3YZP9 Spaca9-202ENSMUST00000124840 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc6D3YZP9 6530401F13Rik-201ENSMUST00000166971 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc6D3YZP9 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc6D3YZP9 Gm28901-201ENSMUST00000188810 474 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc6D3YZP9 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc6D3YZP9 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc6D3YZP9 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc6D3YZP9 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc6D3YZP9 Gm45758-201ENSMUST00000212448 1006 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc6D3YZP9 Gm4930-201ENSMUST00000219926 1087 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc6D3YZP9 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc6D3YZP9 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc6D3YZP9 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc6D3YZP9 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc6D3YZP9 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc6D3YZP9 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc6D3YZP9 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc6D3YZP9 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc6D3YZP9 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc6D3YZP9 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc6D3YZP9 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc6D3YZP9 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc6D3YZP9 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc6D3YZP9 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc6D3YZP9 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc6D3YZP9 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc6D3YZP9 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc6D3YZP9 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc6D3YZP9 Gm8050-201ENSMUST00000171987 1595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc6D3YZP9 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc6D3YZP9 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67 ms