Protein–RNA interactions for Protein: B2RVW2

Clrn2, Clarin 2, mousemouse

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Length 232 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn2B2RVW2 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Clrn2B2RVW2 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Clrn2B2RVW2 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Clrn2B2RVW2 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Clrn2B2RVW2 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Clrn2B2RVW2 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Clrn2B2RVW2 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Clrn2B2RVW2 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Clrn2B2RVW2 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Clrn2B2RVW2 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Clrn2B2RVW2 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Clrn2B2RVW2 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Clrn2B2RVW2 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Clrn2B2RVW2 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Clrn2B2RVW2 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Clrn2B2RVW2 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Clrn2B2RVW2 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Clrn2B2RVW2 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Clrn2B2RVW2 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Clrn2B2RVW2 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Clrn2B2RVW2 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Clrn2B2RVW2 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Clrn2B2RVW2 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Clrn2B2RVW2 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Clrn2B2RVW2 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Clrn2B2RVW2 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Clrn2B2RVW2 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Clrn2B2RVW2 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Clrn2B2RVW2 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Clrn2B2RVW2 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Clrn2B2RVW2 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Clrn2B2RVW2 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Clrn2B2RVW2 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Clrn2B2RVW2 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Clrn2B2RVW2 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Clrn2B2RVW2 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Clrn2B2RVW2 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Clrn2B2RVW2 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Clrn2B2RVW2 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Clrn2B2RVW2 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Clrn2B2RVW2 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Clrn2B2RVW2 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Clrn2B2RVW2 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Clrn2B2RVW2 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Clrn2B2RVW2 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Clrn2B2RVW2 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Clrn2B2RVW2 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Clrn2B2RVW2 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Clrn2B2RVW2 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Clrn2B2RVW2 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Clrn2B2RVW2 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Clrn2B2RVW2 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clrn2B2RVW2 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clrn2B2RVW2 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clrn2B2RVW2 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clrn2B2RVW2 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clrn2B2RVW2 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clrn2B2RVW2 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clrn2B2RVW2 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clrn2B2RVW2 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clrn2B2RVW2 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clrn2B2RVW2 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clrn2B2RVW2 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clrn2B2RVW2 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clrn2B2RVW2 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Clrn2B2RVW2 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Clrn2B2RVW2 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Clrn2B2RVW2 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Clrn2B2RVW2 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Clrn2B2RVW2 Gm15782-201ENSMUST00000121073 445 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Clrn2B2RVW2 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clrn2B2RVW2 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Clrn2B2RVW2 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clrn2B2RVW2 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clrn2B2RVW2 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clrn2B2RVW2 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clrn2B2RVW2 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clrn2B2RVW2 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clrn2B2RVW2 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clrn2B2RVW2 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clrn2B2RVW2 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clrn2B2RVW2 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clrn2B2RVW2 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clrn2B2RVW2 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clrn2B2RVW2 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clrn2B2RVW2 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clrn2B2RVW2 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clrn2B2RVW2 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clrn2B2RVW2 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clrn2B2RVW2 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clrn2B2RVW2 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clrn2B2RVW2 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clrn2B2RVW2 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clrn2B2RVW2 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clrn2B2RVW2 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clrn2B2RVW2 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clrn2B2RVW2 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clrn2B2RVW2 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clrn2B2RVW2 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clrn2B2RVW2 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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