Protein–RNA interactions for Protein: B1AYM9

CK137956, cDNA sequence CK137956, mousemouse

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CK137956B1AYM9 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
CK137956B1AYM9 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.5
CK137956B1AYM9 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
CK137956B1AYM9 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
CK137956B1AYM9 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
CK137956B1AYM9 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
CK137956B1AYM9 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
CK137956B1AYM9 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
CK137956B1AYM9 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
CK137956B1AYM9 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
CK137956B1AYM9 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
CK137956B1AYM9 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CK137956B1AYM9 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CK137956B1AYM9 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CK137956B1AYM9 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CK137956B1AYM9 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CK137956B1AYM9 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
CK137956B1AYM9 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CK137956B1AYM9 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CK137956B1AYM9 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CK137956B1AYM9 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CK137956B1AYM9 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CK137956B1AYM9 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CK137956B1AYM9 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CK137956B1AYM9 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CK137956B1AYM9 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CK137956B1AYM9 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
CK137956B1AYM9 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CK137956B1AYM9 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CK137956B1AYM9 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CK137956B1AYM9 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
CK137956B1AYM9 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
CK137956B1AYM9 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CK137956B1AYM9 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
CK137956B1AYM9 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CK137956B1AYM9 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
CK137956B1AYM9 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
CK137956B1AYM9 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CK137956B1AYM9 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
CK137956B1AYM9 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
CK137956B1AYM9 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CK137956B1AYM9 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CK137956B1AYM9 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CK137956B1AYM9 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CK137956B1AYM9 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CK137956B1AYM9 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CK137956B1AYM9 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CK137956B1AYM9 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CK137956B1AYM9 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CK137956B1AYM9 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CK137956B1AYM9 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CK137956B1AYM9 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CK137956B1AYM9 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CK137956B1AYM9 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CK137956B1AYM9 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CK137956B1AYM9 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CK137956B1AYM9 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CK137956B1AYM9 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CK137956B1AYM9 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CK137956B1AYM9 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CK137956B1AYM9 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CK137956B1AYM9 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CK137956B1AYM9 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
CK137956B1AYM9 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
CK137956B1AYM9 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CK137956B1AYM9 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CK137956B1AYM9 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
CK137956B1AYM9 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
CK137956B1AYM9 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
CK137956B1AYM9 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
CK137956B1AYM9 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
CK137956B1AYM9 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CK137956B1AYM9 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
CK137956B1AYM9 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
CK137956B1AYM9 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
CK137956B1AYM9 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
CK137956B1AYM9 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
CK137956B1AYM9 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CK137956B1AYM9 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
CK137956B1AYM9 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CK137956B1AYM9 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
CK137956B1AYM9 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
CK137956B1AYM9 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
CK137956B1AYM9 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CK137956B1AYM9 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CK137956B1AYM9 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CK137956B1AYM9 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CK137956B1AYM9 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CK137956B1AYM9 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
CK137956B1AYM9 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CK137956B1AYM9 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CK137956B1AYM9 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CK137956B1AYM9 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CK137956B1AYM9 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
CK137956B1AYM9 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CK137956B1AYM9 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CK137956B1AYM9 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CK137956B1AYM9 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
CK137956B1AYM9 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
CK137956B1AYM9 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms