Protein–RNA interactions for Protein: A3KG45

Gm6880, MCG1035527 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6880A3KG45 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm6880A3KG45 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm6880A3KG45 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm6880A3KG45 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm6880A3KG45 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm6880A3KG45 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm6880A3KG45 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm6880A3KG45 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm6880A3KG45 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm6880A3KG45 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm6880A3KG45 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm6880A3KG45 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm6880A3KG45 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm6880A3KG45 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm6880A3KG45 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm6880A3KG45 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm6880A3KG45 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm6880A3KG45 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm6880A3KG45 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm6880A3KG45 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm6880A3KG45 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm6880A3KG45 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm6880A3KG45 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm6880A3KG45 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm6880A3KG45 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm6880A3KG45 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm6880A3KG45 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm6880A3KG45 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm6880A3KG45 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm6880A3KG45 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm6880A3KG45 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm6880A3KG45 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm6880A3KG45 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm6880A3KG45 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm6880A3KG45 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm6880A3KG45 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm6880A3KG45 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm6880A3KG45 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm6880A3KG45 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm6880A3KG45 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm6880A3KG45 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm6880A3KG45 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm6880A3KG45 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm6880A3KG45 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm6880A3KG45 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm6880A3KG45 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm6880A3KG45 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm6880A3KG45 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm6880A3KG45 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm6880A3KG45 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm6880A3KG45 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm6880A3KG45 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm6880A3KG45 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm6880A3KG45 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm6880A3KG45 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm6880A3KG45 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm6880A3KG45 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm6880A3KG45 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm6880A3KG45 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm6880A3KG45 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm6880A3KG45 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm6880A3KG45 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm6880A3KG45 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm6880A3KG45 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm6880A3KG45 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm6880A3KG45 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm6880A3KG45 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm6880A3KG45 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm6880A3KG45 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm6880A3KG45 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm6880A3KG45 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm6880A3KG45 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm6880A3KG45 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm6880A3KG45 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm6880A3KG45 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm6880A3KG45 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm6880A3KG45 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm6880A3KG45 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm6880A3KG45 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm6880A3KG45 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm6880A3KG45 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm6880A3KG45 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm6880A3KG45 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm6880A3KG45 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm6880A3KG45 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm6880A3KG45 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm6880A3KG45 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm6880A3KG45 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm6880A3KG45 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm6880A3KG45 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm6880A3KG45 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm6880A3KG45 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm6880A3KG45 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm6880A3KG45 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm6880A3KG45 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm6880A3KG45 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm6880A3KG45 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm6880A3KG45 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm6880A3KG45 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm6880A3KG45 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms