Protein–RNA interactions for Protein: A2APC3

Ttll9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll9A2APC3 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ttll9A2APC3 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ttll9A2APC3 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Ttll9A2APC3 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ttll9A2APC3 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ttll9A2APC3 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ttll9A2APC3 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ttll9A2APC3 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ttll9A2APC3 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ttll9A2APC3 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ttll9A2APC3 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ttll9A2APC3 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ttll9A2APC3 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ttll9A2APC3 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ttll9A2APC3 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Ttll9A2APC3 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ttll9A2APC3 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ttll9A2APC3 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ttll9A2APC3 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ttll9A2APC3 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ttll9A2APC3 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Ttll9A2APC3 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ttll9A2APC3 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ttll9A2APC3 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Ttll9A2APC3 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ttll9A2APC3 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Ttll9A2APC3 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ttll9A2APC3 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Ttll9A2APC3 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ttll9A2APC3 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ttll9A2APC3 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ttll9A2APC3 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ttll9A2APC3 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ttll9A2APC3 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ttll9A2APC3 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ttll9A2APC3 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ttll9A2APC3 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ttll9A2APC3 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ttll9A2APC3 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ttll9A2APC3 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ttll9A2APC3 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ttll9A2APC3 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ttll9A2APC3 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ttll9A2APC3 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ttll9A2APC3 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ttll9A2APC3 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ttll9A2APC3 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ttll9A2APC3 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Ttll9A2APC3 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ttll9A2APC3 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ttll9A2APC3 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ttll9A2APC3 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ttll9A2APC3 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ttll9A2APC3 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ttll9A2APC3 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Ttll9A2APC3 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ttll9A2APC3 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ttll9A2APC3 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ttll9A2APC3 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ttll9A2APC3 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ttll9A2APC3 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ttll9A2APC3 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Ttll9A2APC3 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ttll9A2APC3 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ttll9A2APC3 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ttll9A2APC3 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ttll9A2APC3 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ttll9A2APC3 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ttll9A2APC3 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ttll9A2APC3 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ttll9A2APC3 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Ttll9A2APC3 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ttll9A2APC3 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ttll9A2APC3 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ttll9A2APC3 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ttll9A2APC3 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ttll9A2APC3 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ttll9A2APC3 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ttll9A2APC3 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ttll9A2APC3 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ttll9A2APC3 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ttll9A2APC3 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ttll9A2APC3 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ttll9A2APC3 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ttll9A2APC3 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Ttll9A2APC3 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ttll9A2APC3 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ttll9A2APC3 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ttll9A2APC3 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ttll9A2APC3 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ttll9A2APC3 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ttll9A2APC3 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ttll9A2APC3 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ttll9A2APC3 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ttll9A2APC3 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ttll9A2APC3 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ttll9A2APC3 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ttll9A2APC3 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Ttll9A2APC3 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ttll9A2APC3 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms