Protein–RNA interactions for Protein: A1L3C8

Gm5089, EG328479 protein, mousemouse

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5089A1L3C8 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5089A1L3C8 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5089A1L3C8 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5089A1L3C8 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5089A1L3C8 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5089A1L3C8 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5089A1L3C8 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5089A1L3C8 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5089A1L3C8 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5089A1L3C8 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5089A1L3C8 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5089A1L3C8 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5089A1L3C8 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5089A1L3C8 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5089A1L3C8 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5089A1L3C8 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5089A1L3C8 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5089A1L3C8 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5089A1L3C8 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5089A1L3C8 Gm15782-201ENSMUST00000121073 445 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5089A1L3C8 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5089A1L3C8 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5089A1L3C8 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5089A1L3C8 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5089A1L3C8 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5089A1L3C8 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5089A1L3C8 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5089A1L3C8 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5089A1L3C8 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5089A1L3C8 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5089A1L3C8 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5089A1L3C8 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5089A1L3C8 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5089A1L3C8 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5089A1L3C8 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5089A1L3C8 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5089A1L3C8 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5089A1L3C8 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5089A1L3C8 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5089A1L3C8 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5089A1L3C8 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5089A1L3C8 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5089A1L3C8 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5089A1L3C8 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5089A1L3C8 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5089A1L3C8 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm5089A1L3C8 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm5089A1L3C8 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm5089A1L3C8 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm5089A1L3C8 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm5089A1L3C8 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm5089A1L3C8 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm5089A1L3C8 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm5089A1L3C8 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm5089A1L3C8 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm5089A1L3C8 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm5089A1L3C8 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm5089A1L3C8 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm5089A1L3C8 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm5089A1L3C8 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm5089A1L3C8 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm5089A1L3C8 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm5089A1L3C8 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm5089A1L3C8 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm5089A1L3C8 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm5089A1L3C8 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm5089A1L3C8 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm5089A1L3C8 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm5089A1L3C8 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm5089A1L3C8 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm5089A1L3C8 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm5089A1L3C8 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm5089A1L3C8 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm5089A1L3C8 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm5089A1L3C8 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm5089A1L3C8 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm5089A1L3C8 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm5089A1L3C8 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm5089A1L3C8 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm5089A1L3C8 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm5089A1L3C8 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm5089A1L3C8 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm5089A1L3C8 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm5089A1L3C8 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm5089A1L3C8 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm5089A1L3C8 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm5089A1L3C8 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm5089A1L3C8 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm5089A1L3C8 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm5089A1L3C8 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm5089A1L3C8 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm5089A1L3C8 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm5089A1L3C8 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm5089A1L3C8 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm5089A1L3C8 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm5089A1L3C8 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm5089A1L3C8 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm5089A1L3C8 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm5089A1L3C8 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm5089A1L3C8 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms