Protein–RNA interactions for Protein: W8DXL4

Lrit3, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 681 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrit3W8DXL4 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Lrit3W8DXL4 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lrit3W8DXL4 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Lrit3W8DXL4 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Lrit3W8DXL4 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lrit3W8DXL4 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Lrit3W8DXL4 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lrit3W8DXL4 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Lrit3W8DXL4 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lrit3W8DXL4 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lrit3W8DXL4 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lrit3W8DXL4 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lrit3W8DXL4 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Lrit3W8DXL4 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lrit3W8DXL4 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lrit3W8DXL4 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Lrit3W8DXL4 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lrit3W8DXL4 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Lrit3W8DXL4 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lrit3W8DXL4 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lrit3W8DXL4 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lrit3W8DXL4 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lrit3W8DXL4 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lrit3W8DXL4 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lrit3W8DXL4 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Lrit3W8DXL4 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lrit3W8DXL4 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
Lrit3W8DXL4 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
Lrit3W8DXL4 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Lrit3W8DXL4 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Lrit3W8DXL4 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Lrit3W8DXL4 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Lrit3W8DXL4 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Lrit3W8DXL4 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Lrit3W8DXL4 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Lrit3W8DXL4 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Lrit3W8DXL4 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Lrit3W8DXL4 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Lrit3W8DXL4 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Lrit3W8DXL4 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Lrit3W8DXL4 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Lrit3W8DXL4 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Lrit3W8DXL4 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Lrit3W8DXL4 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Lrit3W8DXL4 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Lrit3W8DXL4 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Lrit3W8DXL4 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Lrit3W8DXL4 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Lrit3W8DXL4 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Lrit3W8DXL4 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Lrit3W8DXL4 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Lrit3W8DXL4 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Lrit3W8DXL4 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Lrit3W8DXL4 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Lrit3W8DXL4 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Lrit3W8DXL4 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Lrit3W8DXL4 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Lrit3W8DXL4 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Lrit3W8DXL4 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Lrit3W8DXL4 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Lrit3W8DXL4 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Lrit3W8DXL4 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Lrit3W8DXL4 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Lrit3W8DXL4 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Lrit3W8DXL4 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Lrit3W8DXL4 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Lrit3W8DXL4 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Lrit3W8DXL4 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Lrit3W8DXL4 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Lrit3W8DXL4 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Lrit3W8DXL4 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Lrit3W8DXL4 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Lrit3W8DXL4 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Lrit3W8DXL4 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Lrit3W8DXL4 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Lrit3W8DXL4 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Lrit3W8DXL4 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Lrit3W8DXL4 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Lrit3W8DXL4 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Lrit3W8DXL4 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Lrit3W8DXL4 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Lrit3W8DXL4 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Lrit3W8DXL4 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Lrit3W8DXL4 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Lrit3W8DXL4 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Lrit3W8DXL4 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Lrit3W8DXL4 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Lrit3W8DXL4 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Lrit3W8DXL4 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Lrit3W8DXL4 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Lrit3W8DXL4 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Lrit3W8DXL4 Gm11831-201ENSMUST00000141538 629 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Lrit3W8DXL4 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Lrit3W8DXL4 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Lrit3W8DXL4 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Lrit3W8DXL4 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Lrit3W8DXL4 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Lrit3W8DXL4 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Lrit3W8DXL4 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Lrit3W8DXL4 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms