Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP1

Speer3, MCG129800, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer3W4VSP1 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Speer3W4VSP1 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Speer3W4VSP1 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Speer3W4VSP1 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Speer3W4VSP1 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Speer3W4VSP1 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Speer3W4VSP1 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Speer3W4VSP1 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Speer3W4VSP1 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Speer3W4VSP1 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Speer3W4VSP1 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Speer3W4VSP1 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Speer3W4VSP1 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Speer3W4VSP1 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Speer3W4VSP1 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Speer3W4VSP1 Gm13571-201ENSMUST00000124654 1381 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Speer3W4VSP1 Olfr1171-ps1-202ENSMUST00000150178 1398 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Speer3W4VSP1 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Speer3W4VSP1 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Speer3W4VSP1 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Speer3W4VSP1 Smgc-203ENSMUST00000109276 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Speer3W4VSP1 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Speer3W4VSP1 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Speer3W4VSP1 Gm13505-201ENSMUST00000121666 817 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Speer3W4VSP1 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Speer3W4VSP1 Gm15952-202ENSMUST00000144542 556 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Speer3W4VSP1 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Speer3W4VSP1 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Speer3W4VSP1 Gm8581-201ENSMUST00000188636 890 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Speer3W4VSP1 B230110G15Rik-201ENSMUST00000190868 772 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Speer3W4VSP1 Gm38280-201ENSMUST00000192610 158 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Speer3W4VSP1 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Speer3W4VSP1 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Speer3W4VSP1 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Speer3W4VSP1 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Speer3W4VSP1 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Speer3W4VSP1 AC154441.1-201ENSMUST00000223653 1006 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Speer3W4VSP1 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Speer3W4VSP1 Vmn1r85-201ENSMUST00000094829 927 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Speer3W4VSP1 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Speer3W4VSP1 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Speer3W4VSP1 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Speer3W4VSP1 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Speer3W4VSP1 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Speer3W4VSP1 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Speer3W4VSP1 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Speer3W4VSP1 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Speer3W4VSP1 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Speer3W4VSP1 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Speer3W4VSP1 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Speer3W4VSP1 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Speer3W4VSP1 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Speer3W4VSP1 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Speer3W4VSP1 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Speer3W4VSP1 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Speer3W4VSP1 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Speer3W4VSP1 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Speer3W4VSP1 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Speer3W4VSP1 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Speer3W4VSP1 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Speer3W4VSP1 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Speer3W4VSP1 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Speer3W4VSP1 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Speer3W4VSP1 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Speer3W4VSP1 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Speer3W4VSP1 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Speer3W4VSP1 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Speer3W4VSP1 Gm25843-201ENSMUST00000122582 314 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Speer3W4VSP1 Gm16158-201ENSMUST00000123509 785 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Speer3W4VSP1 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Speer3W4VSP1 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Speer3W4VSP1 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Speer3W4VSP1 Gm17134-201ENSMUST00000166593 437 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Speer3W4VSP1 Gm17983-201ENSMUST00000190766 594 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Speer3W4VSP1 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Speer3W4VSP1 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Speer3W4VSP1 Gm42588-201ENSMUST00000200538 1297 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Speer3W4VSP1 Olfr1480-203ENSMUST00000207904 1209 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Speer3W4VSP1 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Speer3W4VSP1 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Speer3W4VSP1 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Speer3W4VSP1 CT030194.1-201ENSMUST00000225507 532 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Speer3W4VSP1 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Speer3W4VSP1 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Speer3W4VSP1 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Speer3W4VSP1 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Speer3W4VSP1 Olfr1480-201ENSMUST00000072219 948 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Speer3W4VSP1 Gm22005-201ENSMUST00000082795 141 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Speer3W4VSP1 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Speer3W4VSP1 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Speer3W4VSP1 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Speer3W4VSP1 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Speer3W4VSP1 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Speer3W4VSP1 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Speer3W4VSP1 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Speer3W4VSP1 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Speer3W4VSP1 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Speer3W4VSP1 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Speer3W4VSP1 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Speer3W4VSP1 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.7 ms