Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN7

Gm3550, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3550W4VSN7 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
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