Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V9

Ccni, Cyclin-I, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcniQ9Z2V9 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
CcniQ9Z2V9 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
CcniQ9Z2V9 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
CcniQ9Z2V9 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
CcniQ9Z2V9 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
CcniQ9Z2V9 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
CcniQ9Z2V9 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
CcniQ9Z2V9 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
CcniQ9Z2V9 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
CcniQ9Z2V9 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
CcniQ9Z2V9 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
CcniQ9Z2V9 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
CcniQ9Z2V9 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
CcniQ9Z2V9 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
CcniQ9Z2V9 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
CcniQ9Z2V9 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
CcniQ9Z2V9 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
CcniQ9Z2V9 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
CcniQ9Z2V9 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
CcniQ9Z2V9 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
CcniQ9Z2V9 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
CcniQ9Z2V9 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
CcniQ9Z2V9 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
CcniQ9Z2V9 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
CcniQ9Z2V9 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
CcniQ9Z2V9 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
CcniQ9Z2V9 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
CcniQ9Z2V9 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
CcniQ9Z2V9 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
CcniQ9Z2V9 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
CcniQ9Z2V9 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
CcniQ9Z2V9 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
CcniQ9Z2V9 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
CcniQ9Z2V9 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
CcniQ9Z2V9 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
CcniQ9Z2V9 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
CcniQ9Z2V9 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
CcniQ9Z2V9 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
CcniQ9Z2V9 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
CcniQ9Z2V9 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
CcniQ9Z2V9 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
CcniQ9Z2V9 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
CcniQ9Z2V9 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
CcniQ9Z2V9 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
CcniQ9Z2V9 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
CcniQ9Z2V9 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
CcniQ9Z2V9 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
CcniQ9Z2V9 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
CcniQ9Z2V9 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
CcniQ9Z2V9 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
CcniQ9Z2V9 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
CcniQ9Z2V9 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
CcniQ9Z2V9 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
CcniQ9Z2V9 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
CcniQ9Z2V9 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
CcniQ9Z2V9 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
CcniQ9Z2V9 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
CcniQ9Z2V9 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
CcniQ9Z2V9 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
CcniQ9Z2V9 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
CcniQ9Z2V9 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
CcniQ9Z2V9 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
CcniQ9Z2V9 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
CcniQ9Z2V9 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
CcniQ9Z2V9 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
CcniQ9Z2V9 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
CcniQ9Z2V9 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
CcniQ9Z2V9 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
CcniQ9Z2V9 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
CcniQ9Z2V9 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
CcniQ9Z2V9 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
CcniQ9Z2V9 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
CcniQ9Z2V9 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
CcniQ9Z2V9 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
CcniQ9Z2V9 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
CcniQ9Z2V9 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
CcniQ9Z2V9 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
CcniQ9Z2V9 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
CcniQ9Z2V9 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
CcniQ9Z2V9 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
CcniQ9Z2V9 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
CcniQ9Z2V9 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
CcniQ9Z2V9 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
CcniQ9Z2V9 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
CcniQ9Z2V9 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
CcniQ9Z2V9 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
CcniQ9Z2V9 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
CcniQ9Z2V9 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
CcniQ9Z2V9 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
CcniQ9Z2V9 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
CcniQ9Z2V9 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
CcniQ9Z2V9 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
CcniQ9Z2V9 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
CcniQ9Z2V9 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
CcniQ9Z2V9 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
CcniQ9Z2V9 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
CcniQ9Z2V9 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
CcniQ9Z2V9 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
CcniQ9Z2V9 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
CcniQ9Z2V9 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms