Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2C6

Upk1b, Uroplakin-1b, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk1bQ9Z2C6 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Upk1bQ9Z2C6 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Upk1bQ9Z2C6 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Upk1bQ9Z2C6 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Upk1bQ9Z2C6 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Upk1bQ9Z2C6 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Upk1bQ9Z2C6 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Upk1bQ9Z2C6 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Upk1bQ9Z2C6 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Upk1bQ9Z2C6 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Upk1bQ9Z2C6 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Upk1bQ9Z2C6 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Upk1bQ9Z2C6 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Upk1bQ9Z2C6 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Upk1bQ9Z2C6 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Upk1bQ9Z2C6 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Upk1bQ9Z2C6 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Upk1bQ9Z2C6 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Upk1bQ9Z2C6 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Upk1bQ9Z2C6 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Upk1bQ9Z2C6 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Upk1bQ9Z2C6 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Upk1bQ9Z2C6 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Upk1bQ9Z2C6 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Upk1bQ9Z2C6 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Upk1bQ9Z2C6 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Upk1bQ9Z2C6 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Upk1bQ9Z2C6 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Upk1bQ9Z2C6 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Upk1bQ9Z2C6 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Upk1bQ9Z2C6 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Upk1bQ9Z2C6 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
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Upk1bQ9Z2C6 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Upk1bQ9Z2C6 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Upk1bQ9Z2C6 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Upk1bQ9Z2C6 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Upk1bQ9Z2C6 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Upk1bQ9Z2C6 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Upk1bQ9Z2C6 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Upk1bQ9Z2C6 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Upk1bQ9Z2C6 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Upk1bQ9Z2C6 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Upk1bQ9Z2C6 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Upk1bQ9Z2C6 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Upk1bQ9Z2C6 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Upk1bQ9Z2C6 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Upk1bQ9Z2C6 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Upk1bQ9Z2C6 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Upk1bQ9Z2C6 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Upk1bQ9Z2C6 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Upk1bQ9Z2C6 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Upk1bQ9Z2C6 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Upk1bQ9Z2C6 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Upk1bQ9Z2C6 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Upk1bQ9Z2C6 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Upk1bQ9Z2C6 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Upk1bQ9Z2C6 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Upk1bQ9Z2C6 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Upk1bQ9Z2C6 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Upk1bQ9Z2C6 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
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Upk1bQ9Z2C6 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Upk1bQ9Z2C6 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Upk1bQ9Z2C6 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Upk1bQ9Z2C6 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Upk1bQ9Z2C6 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Upk1bQ9Z2C6 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Upk1bQ9Z2C6 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Upk1bQ9Z2C6 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Upk1bQ9Z2C6 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Upk1bQ9Z2C6 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Upk1bQ9Z2C6 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Upk1bQ9Z2C6 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Upk1bQ9Z2C6 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Upk1bQ9Z2C6 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Upk1bQ9Z2C6 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Upk1bQ9Z2C6 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Upk1bQ9Z2C6 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Upk1bQ9Z2C6 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Upk1bQ9Z2C6 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Upk1bQ9Z2C6 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Upk1bQ9Z2C6 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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