Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1D9

Znf394, Zinc finger protein 394, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf394Q9Z1D9 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Znf394Q9Z1D9 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Znf394Q9Z1D9 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Znf394Q9Z1D9 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Znf394Q9Z1D9 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Znf394Q9Z1D9 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Znf394Q9Z1D9 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Znf394Q9Z1D9 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Znf394Q9Z1D9 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Znf394Q9Z1D9 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Znf394Q9Z1D9 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Znf394Q9Z1D9 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Znf394Q9Z1D9 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Znf394Q9Z1D9 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Znf394Q9Z1D9 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Znf394Q9Z1D9 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Znf394Q9Z1D9 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Znf394Q9Z1D9 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Znf394Q9Z1D9 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Znf394Q9Z1D9 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Znf394Q9Z1D9 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Znf394Q9Z1D9 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Znf394Q9Z1D9 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Znf394Q9Z1D9 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Znf394Q9Z1D9 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Znf394Q9Z1D9 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Znf394Q9Z1D9 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Znf394Q9Z1D9 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Znf394Q9Z1D9 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Znf394Q9Z1D9 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Znf394Q9Z1D9 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Znf394Q9Z1D9 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Znf394Q9Z1D9 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Znf394Q9Z1D9 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Znf394Q9Z1D9 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Znf394Q9Z1D9 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Znf394Q9Z1D9 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Znf394Q9Z1D9 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Znf394Q9Z1D9 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Znf394Q9Z1D9 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Znf394Q9Z1D9 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Znf394Q9Z1D9 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Znf394Q9Z1D9 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Znf394Q9Z1D9 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Znf394Q9Z1D9 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Znf394Q9Z1D9 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Znf394Q9Z1D9 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Znf394Q9Z1D9 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Znf394Q9Z1D9 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Znf394Q9Z1D9 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Znf394Q9Z1D9 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Znf394Q9Z1D9 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Znf394Q9Z1D9 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Znf394Q9Z1D9 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Znf394Q9Z1D9 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Znf394Q9Z1D9 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Znf394Q9Z1D9 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Znf394Q9Z1D9 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Znf394Q9Z1D9 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Znf394Q9Z1D9 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Znf394Q9Z1D9 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Znf394Q9Z1D9 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Znf394Q9Z1D9 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Znf394Q9Z1D9 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Znf394Q9Z1D9 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Znf394Q9Z1D9 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Znf394Q9Z1D9 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Znf394Q9Z1D9 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Znf394Q9Z1D9 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Znf394Q9Z1D9 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Znf394Q9Z1D9 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Znf394Q9Z1D9 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Znf394Q9Z1D9 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Znf394Q9Z1D9 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Znf394Q9Z1D9 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Znf394Q9Z1D9 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Znf394Q9Z1D9 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Znf394Q9Z1D9 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Znf394Q9Z1D9 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Znf394Q9Z1D9 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Znf394Q9Z1D9 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Znf394Q9Z1D9 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Znf394Q9Z1D9 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Znf394Q9Z1D9 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Znf394Q9Z1D9 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Znf394Q9Z1D9 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Znf394Q9Z1D9 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Znf394Q9Z1D9 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Znf394Q9Z1D9 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Znf394Q9Z1D9 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Znf394Q9Z1D9 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Znf394Q9Z1D9 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Znf394Q9Z1D9 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Znf394Q9Z1D9 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Znf394Q9Z1D9 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Znf394Q9Z1D9 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Znf394Q9Z1D9 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Znf394Q9Z1D9 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Znf394Q9Z1D9 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Znf394Q9Z1D9 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.1 ms