Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0H8

Clip2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,047 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip2Q9Z0H8 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Clip2Q9Z0H8 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Clip2Q9Z0H8 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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