Protein–RNA interactions for Protein: Q9R059

Fhl3, Four and a half LIM domains protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fhl3Q9R059 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Fhl3Q9R059 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Fhl3Q9R059 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Fhl3Q9R059 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Fhl3Q9R059 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Fhl3Q9R059 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Fhl3Q9R059 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Fhl3Q9R059 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Fhl3Q9R059 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Fhl3Q9R059 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Fhl3Q9R059 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Fhl3Q9R059 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Fhl3Q9R059 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Fhl3Q9R059 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Fhl3Q9R059 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Fhl3Q9R059 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Fhl3Q9R059 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Fhl3Q9R059 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Fhl3Q9R059 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Fhl3Q9R059 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Fhl3Q9R059 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Fhl3Q9R059 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Fhl3Q9R059 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Fhl3Q9R059 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Fhl3Q9R059 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Fhl3Q9R059 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Fhl3Q9R059 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Fhl3Q9R059 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Fhl3Q9R059 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Fhl3Q9R059 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Fhl3Q9R059 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Fhl3Q9R059 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Fhl3Q9R059 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Fhl3Q9R059 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Fhl3Q9R059 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Fhl3Q9R059 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Fhl3Q9R059 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Fhl3Q9R059 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Fhl3Q9R059 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Fhl3Q9R059 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Fhl3Q9R059 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Fhl3Q9R059 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Fhl3Q9R059 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Fhl3Q9R059 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Fhl3Q9R059 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Fhl3Q9R059 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Fhl3Q9R059 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Fhl3Q9R059 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Fhl3Q9R059 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Fhl3Q9R059 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Fhl3Q9R059 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Fhl3Q9R059 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Fhl3Q9R059 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Fhl3Q9R059 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Fhl3Q9R059 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Fhl3Q9R059 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Fhl3Q9R059 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Fhl3Q9R059 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Fhl3Q9R059 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Fhl3Q9R059 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Fhl3Q9R059 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Fhl3Q9R059 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Fhl3Q9R059 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Fhl3Q9R059 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Fhl3Q9R059 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Fhl3Q9R059 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Fhl3Q9R059 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Fhl3Q9R059 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Fhl3Q9R059 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Fhl3Q9R059 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Fhl3Q9R059 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Fhl3Q9R059 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Fhl3Q9R059 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Fhl3Q9R059 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Fhl3Q9R059 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Fhl3Q9R059 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Fhl3Q9R059 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Fhl3Q9R059 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Fhl3Q9R059 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Fhl3Q9R059 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Fhl3Q9R059 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Fhl3Q9R059 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Fhl3Q9R059 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Fhl3Q9R059 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Fhl3Q9R059 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Fhl3Q9R059 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Fhl3Q9R059 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Fhl3Q9R059 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Fhl3Q9R059 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Fhl3Q9R059 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Fhl3Q9R059 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Fhl3Q9R059 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Fhl3Q9R059 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Fhl3Q9R059 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Fhl3Q9R059 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Fhl3Q9R059 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Fhl3Q9R059 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Fhl3Q9R059 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Fhl3Q9R059 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Fhl3Q9R059 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58 ms