Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZW0

Atp11c, Phospholipid-transporting ATPase 11C, mousemouse

Predictions only

Length 1,129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp11cQ9QZW0 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Atp11cQ9QZW0 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atp11cQ9QZW0 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atp11cQ9QZW0 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atp11cQ9QZW0 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atp11cQ9QZW0 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atp11cQ9QZW0 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atp11cQ9QZW0 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atp11cQ9QZW0 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atp11cQ9QZW0 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atp11cQ9QZW0 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atp11cQ9QZW0 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atp11cQ9QZW0 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atp11cQ9QZW0 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atp11cQ9QZW0 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atp11cQ9QZW0 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atp11cQ9QZW0 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Atp11cQ9QZW0 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atp11cQ9QZW0 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atp11cQ9QZW0 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atp11cQ9QZW0 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atp11cQ9QZW0 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atp11cQ9QZW0 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atp11cQ9QZW0 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Atp11cQ9QZW0 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atp11cQ9QZW0 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atp11cQ9QZW0 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Atp11cQ9QZW0 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atp11cQ9QZW0 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Atp11cQ9QZW0 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atp11cQ9QZW0 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Atp11cQ9QZW0 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atp11cQ9QZW0 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atp11cQ9QZW0 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atp11cQ9QZW0 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atp11cQ9QZW0 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atp11cQ9QZW0 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Atp11cQ9QZW0 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atp11cQ9QZW0 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atp11cQ9QZW0 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atp11cQ9QZW0 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atp11cQ9QZW0 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atp11cQ9QZW0 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atp11cQ9QZW0 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atp11cQ9QZW0 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Atp11cQ9QZW0 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Atp11cQ9QZW0 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Atp11cQ9QZW0 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atp11cQ9QZW0 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atp11cQ9QZW0 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atp11cQ9QZW0 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atp11cQ9QZW0 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atp11cQ9QZW0 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atp11cQ9QZW0 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atp11cQ9QZW0 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atp11cQ9QZW0 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atp11cQ9QZW0 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atp11cQ9QZW0 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atp11cQ9QZW0 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atp11cQ9QZW0 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atp11cQ9QZW0 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Atp11cQ9QZW0 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atp11cQ9QZW0 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Atp11cQ9QZW0 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Atp11cQ9QZW0 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Atp11cQ9QZW0 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atp11cQ9QZW0 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atp11cQ9QZW0 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Atp11cQ9QZW0 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atp11cQ9QZW0 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atp11cQ9QZW0 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atp11cQ9QZW0 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atp11cQ9QZW0 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atp11cQ9QZW0 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atp11cQ9QZW0 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atp11cQ9QZW0 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Atp11cQ9QZW0 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Atp11cQ9QZW0 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atp11cQ9QZW0 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atp11cQ9QZW0 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atp11cQ9QZW0 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atp11cQ9QZW0 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atp11cQ9QZW0 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atp11cQ9QZW0 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atp11cQ9QZW0 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atp11cQ9QZW0 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atp11cQ9QZW0 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Atp11cQ9QZW0 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atp11cQ9QZW0 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atp11cQ9QZW0 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atp11cQ9QZW0 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atp11cQ9QZW0 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atp11cQ9QZW0 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Atp11cQ9QZW0 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Atp11cQ9QZW0 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Atp11cQ9QZW0 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Atp11cQ9QZW0 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Atp11cQ9QZW0 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atp11cQ9QZW0 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atp11cQ9QZW0 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms