Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZC1

Trpc3, Short transient receptor potential channel 3, mousemouse

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Length 836 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc3Q9QZC1 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Trpc3Q9QZC1 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Trpc3Q9QZC1 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Trpc3Q9QZC1 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trpc3Q9QZC1 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trpc3Q9QZC1 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trpc3Q9QZC1 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trpc3Q9QZC1 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trpc3Q9QZC1 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trpc3Q9QZC1 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trpc3Q9QZC1 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trpc3Q9QZC1 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Trpc3Q9QZC1 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trpc3Q9QZC1 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trpc3Q9QZC1 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trpc3Q9QZC1 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Trpc3Q9QZC1 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trpc3Q9QZC1 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trpc3Q9QZC1 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trpc3Q9QZC1 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Trpc3Q9QZC1 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Trpc3Q9QZC1 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Trpc3Q9QZC1 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trpc3Q9QZC1 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trpc3Q9QZC1 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Trpc3Q9QZC1 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trpc3Q9QZC1 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Trpc3Q9QZC1 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trpc3Q9QZC1 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Trpc3Q9QZC1 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trpc3Q9QZC1 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Trpc3Q9QZC1 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trpc3Q9QZC1 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Trpc3Q9QZC1 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Trpc3Q9QZC1 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Trpc3Q9QZC1 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trpc3Q9QZC1 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trpc3Q9QZC1 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trpc3Q9QZC1 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trpc3Q9QZC1 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trpc3Q9QZC1 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trpc3Q9QZC1 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trpc3Q9QZC1 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Trpc3Q9QZC1 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trpc3Q9QZC1 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trpc3Q9QZC1 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trpc3Q9QZC1 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trpc3Q9QZC1 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trpc3Q9QZC1 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Trpc3Q9QZC1 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trpc3Q9QZC1 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trpc3Q9QZC1 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
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Trpc3Q9QZC1 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trpc3Q9QZC1 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trpc3Q9QZC1 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Trpc3Q9QZC1 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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Trpc3Q9QZC1 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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