Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYF1

Rdh11, Retinol dehydrogenase 11, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh11Q9QYF1 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rdh11Q9QYF1 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rdh11Q9QYF1 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rdh11Q9QYF1 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rdh11Q9QYF1 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rdh11Q9QYF1 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Rdh11Q9QYF1 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Rdh11Q9QYF1 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rdh11Q9QYF1 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rdh11Q9QYF1 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rdh11Q9QYF1 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rdh11Q9QYF1 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rdh11Q9QYF1 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rdh11Q9QYF1 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rdh11Q9QYF1 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rdh11Q9QYF1 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rdh11Q9QYF1 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rdh11Q9QYF1 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rdh11Q9QYF1 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rdh11Q9QYF1 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rdh11Q9QYF1 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rdh11Q9QYF1 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rdh11Q9QYF1 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rdh11Q9QYF1 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Rdh11Q9QYF1 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Rdh11Q9QYF1 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rdh11Q9QYF1 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rdh11Q9QYF1 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rdh11Q9QYF1 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rdh11Q9QYF1 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rdh11Q9QYF1 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rdh11Q9QYF1 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rdh11Q9QYF1 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rdh11Q9QYF1 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rdh11Q9QYF1 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rdh11Q9QYF1 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rdh11Q9QYF1 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rdh11Q9QYF1 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rdh11Q9QYF1 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rdh11Q9QYF1 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rdh11Q9QYF1 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rdh11Q9QYF1 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Rdh11Q9QYF1 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Rdh11Q9QYF1 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Rdh11Q9QYF1 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Rdh11Q9QYF1 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rdh11Q9QYF1 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rdh11Q9QYF1 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rdh11Q9QYF1 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rdh11Q9QYF1 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rdh11Q9QYF1 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rdh11Q9QYF1 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rdh11Q9QYF1 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rdh11Q9QYF1 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rdh11Q9QYF1 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rdh11Q9QYF1 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rdh11Q9QYF1 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rdh11Q9QYF1 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rdh11Q9QYF1 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rdh11Q9QYF1 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rdh11Q9QYF1 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rdh11Q9QYF1 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rdh11Q9QYF1 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rdh11Q9QYF1 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rdh11Q9QYF1 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rdh11Q9QYF1 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rdh11Q9QYF1 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Rdh11Q9QYF1 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Rdh11Q9QYF1 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Rdh11Q9QYF1 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rdh11Q9QYF1 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rdh11Q9QYF1 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Rdh11Q9QYF1 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rdh11Q9QYF1 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Rdh11Q9QYF1 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rdh11Q9QYF1 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rdh11Q9QYF1 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Rdh11Q9QYF1 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Rdh11Q9QYF1 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rdh11Q9QYF1 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Rdh11Q9QYF1 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rdh11Q9QYF1 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rdh11Q9QYF1 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rdh11Q9QYF1 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rdh11Q9QYF1 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rdh11Q9QYF1 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rdh11Q9QYF1 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rdh11Q9QYF1 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rdh11Q9QYF1 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rdh11Q9QYF1 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rdh11Q9QYF1 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rdh11Q9QYF1 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rdh11Q9QYF1 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rdh11Q9QYF1 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rdh11Q9QYF1 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rdh11Q9QYF1 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rdh11Q9QYF1 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rdh11Q9QYF1 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rdh11Q9QYF1 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rdh11Q9QYF1 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms