Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXG2

Chm, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, mousemouse

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Length 665 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmQ9QXG2 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ChmQ9QXG2 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ChmQ9QXG2 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ChmQ9QXG2 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ChmQ9QXG2 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ChmQ9QXG2 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
ChmQ9QXG2 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ChmQ9QXG2 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ChmQ9QXG2 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ChmQ9QXG2 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ChmQ9QXG2 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ChmQ9QXG2 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ChmQ9QXG2 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ChmQ9QXG2 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ChmQ9QXG2 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ChmQ9QXG2 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ChmQ9QXG2 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ChmQ9QXG2 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ChmQ9QXG2 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ChmQ9QXG2 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ChmQ9QXG2 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ChmQ9QXG2 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ChmQ9QXG2 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ChmQ9QXG2 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ChmQ9QXG2 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ChmQ9QXG2 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ChmQ9QXG2 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ChmQ9QXG2 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ChmQ9QXG2 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
ChmQ9QXG2 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ChmQ9QXG2 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ChmQ9QXG2 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
ChmQ9QXG2 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ChmQ9QXG2 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ChmQ9QXG2 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ChmQ9QXG2 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
ChmQ9QXG2 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ChmQ9QXG2 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ChmQ9QXG2 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ChmQ9QXG2 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
ChmQ9QXG2 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
ChmQ9QXG2 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
ChmQ9QXG2 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
ChmQ9QXG2 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
ChmQ9QXG2 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
ChmQ9QXG2 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
ChmQ9QXG2 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
ChmQ9QXG2 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
ChmQ9QXG2 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
ChmQ9QXG2 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
ChmQ9QXG2 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
ChmQ9QXG2 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ChmQ9QXG2 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ChmQ9QXG2 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
ChmQ9QXG2 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ChmQ9QXG2 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ChmQ9QXG2 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
ChmQ9QXG2 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
ChmQ9QXG2 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ChmQ9QXG2 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ChmQ9QXG2 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ChmQ9QXG2 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ChmQ9QXG2 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
ChmQ9QXG2 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
ChmQ9QXG2 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
ChmQ9QXG2 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ChmQ9QXG2 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ChmQ9QXG2 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
ChmQ9QXG2 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ChmQ9QXG2 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ChmQ9QXG2 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ChmQ9QXG2 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ChmQ9QXG2 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ChmQ9QXG2 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ChmQ9QXG2 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ChmQ9QXG2 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ChmQ9QXG2 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ChmQ9QXG2 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ChmQ9QXG2 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ChmQ9QXG2 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ChmQ9QXG2 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ChmQ9QXG2 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ChmQ9QXG2 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ChmQ9QXG2 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ChmQ9QXG2 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ChmQ9QXG2 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ChmQ9QXG2 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ChmQ9QXG2 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
ChmQ9QXG2 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ChmQ9QXG2 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ChmQ9QXG2 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
ChmQ9QXG2 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ChmQ9QXG2 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ChmQ9QXG2 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ChmQ9QXG2 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ChmQ9QXG2 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ChmQ9QXG2 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ChmQ9QXG2 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ChmQ9QXG2 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ChmQ9QXG2 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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