Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMK2

Csnk1e, Casein kinase I isoform epsilon, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1eQ9JMK2 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Csnk1eQ9JMK2 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Csnk1eQ9JMK2 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Csnk1eQ9JMK2 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Csnk1eQ9JMK2 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Csnk1eQ9JMK2 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Csnk1eQ9JMK2 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Csnk1eQ9JMK2 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Csnk1eQ9JMK2 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Csnk1eQ9JMK2 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Csnk1eQ9JMK2 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Csnk1eQ9JMK2 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Csnk1eQ9JMK2 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Csnk1eQ9JMK2 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Csnk1eQ9JMK2 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Csnk1eQ9JMK2 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Csnk1eQ9JMK2 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Csnk1eQ9JMK2 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Csnk1eQ9JMK2 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Csnk1eQ9JMK2 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Csnk1eQ9JMK2 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Csnk1eQ9JMK2 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Csnk1eQ9JMK2 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Csnk1eQ9JMK2 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Csnk1eQ9JMK2 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Csnk1eQ9JMK2 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Csnk1eQ9JMK2 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Csnk1eQ9JMK2 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Csnk1eQ9JMK2 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Csnk1eQ9JMK2 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Csnk1eQ9JMK2 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Csnk1eQ9JMK2 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Csnk1eQ9JMK2 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Csnk1eQ9JMK2 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Csnk1eQ9JMK2 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Csnk1eQ9JMK2 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Csnk1eQ9JMK2 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Csnk1eQ9JMK2 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Csnk1eQ9JMK2 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Csnk1eQ9JMK2 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Csnk1eQ9JMK2 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Csnk1eQ9JMK2 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Csnk1eQ9JMK2 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Csnk1eQ9JMK2 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Csnk1eQ9JMK2 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Csnk1eQ9JMK2 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Csnk1eQ9JMK2 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Csnk1eQ9JMK2 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Csnk1eQ9JMK2 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Csnk1eQ9JMK2 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Csnk1eQ9JMK2 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Csnk1eQ9JMK2 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Csnk1eQ9JMK2 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Csnk1eQ9JMK2 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Csnk1eQ9JMK2 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Csnk1eQ9JMK2 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Csnk1eQ9JMK2 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Csnk1eQ9JMK2 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Csnk1eQ9JMK2 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Csnk1eQ9JMK2 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Csnk1eQ9JMK2 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Csnk1eQ9JMK2 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Csnk1eQ9JMK2 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Csnk1eQ9JMK2 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Csnk1eQ9JMK2 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Csnk1eQ9JMK2 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Csnk1eQ9JMK2 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Csnk1eQ9JMK2 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Csnk1eQ9JMK2 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Csnk1eQ9JMK2 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Csnk1eQ9JMK2 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Csnk1eQ9JMK2 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Csnk1eQ9JMK2 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Csnk1eQ9JMK2 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Csnk1eQ9JMK2 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Csnk1eQ9JMK2 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Csnk1eQ9JMK2 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Csnk1eQ9JMK2 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Csnk1eQ9JMK2 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Csnk1eQ9JMK2 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Csnk1eQ9JMK2 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Csnk1eQ9JMK2 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Csnk1eQ9JMK2 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Csnk1eQ9JMK2 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Csnk1eQ9JMK2 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Csnk1eQ9JMK2 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Csnk1eQ9JMK2 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Csnk1eQ9JMK2 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Csnk1eQ9JMK2 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Csnk1eQ9JMK2 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Csnk1eQ9JMK2 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Csnk1eQ9JMK2 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Csnk1eQ9JMK2 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Csnk1eQ9JMK2 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Csnk1eQ9JMK2 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Csnk1eQ9JMK2 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Csnk1eQ9JMK2 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Csnk1eQ9JMK2 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Csnk1eQ9JMK2 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Csnk1eQ9JMK2 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
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