Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMD1

Sfmbt1, Scm-like with four MBT domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt1Q9JMD1 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sfmbt1Q9JMD1 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sfmbt1Q9JMD1 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sfmbt1Q9JMD1 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sfmbt1Q9JMD1 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sfmbt1Q9JMD1 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sfmbt1Q9JMD1 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sfmbt1Q9JMD1 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sfmbt1Q9JMD1 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Sfmbt1Q9JMD1 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sfmbt1Q9JMD1 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sfmbt1Q9JMD1 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sfmbt1Q9JMD1 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sfmbt1Q9JMD1 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Sfmbt1Q9JMD1 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms