Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLM8

Dclk1, Serine/threonine-protein kinase DCLK1, mousemouse

Predictions only

Length 756 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dclk1Q9JLM8 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dclk1Q9JLM8 Hils1-201ENSMUST00000038928 864 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dclk1Q9JLM8 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dclk1Q9JLM8 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dclk1Q9JLM8 Fbxo15-201ENSMUST00000037718 1437 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dclk1Q9JLM8 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dclk1Q9JLM8 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dclk1Q9JLM8 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Dclk1Q9JLM8 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dclk1Q9JLM8 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dclk1Q9JLM8 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dclk1Q9JLM8 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Dclk1Q9JLM8 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dclk1Q9JLM8 EU599041-202ENSMUST00000205291 1386 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dclk1Q9JLM8 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dclk1Q9JLM8 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dclk1Q9JLM8 Gm6831-202ENSMUST00000213025 1673 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Dclk1Q9JLM8 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Dclk1Q9JLM8 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Dclk1Q9JLM8 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Dclk1Q9JLM8 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Dclk1Q9JLM8 Clec4a3-201ENSMUST00000088468 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Dclk1Q9JLM8 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Dclk1Q9JLM8 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Dclk1Q9JLM8 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Dclk1Q9JLM8 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Dclk1Q9JLM8 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Dclk1Q9JLM8 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Dclk1Q9JLM8 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Dclk1Q9JLM8 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Dclk1Q9JLM8 Opn1mw-202ENSMUST00000101457 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Dclk1Q9JLM8 Srd5a3-202ENSMUST00000113506 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Dclk1Q9JLM8 Aamdc-207ENSMUST00000138060 467 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Dclk1Q9JLM8 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Dclk1Q9JLM8 Gm8723-201ENSMUST00000166076 820 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Dclk1Q9JLM8 Gm8701-201ENSMUST00000169259 874 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Dclk1Q9JLM8 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Dclk1Q9JLM8 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Dclk1Q9JLM8 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Dclk1Q9JLM8 Gm18801-201ENSMUST00000186616 536 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Dclk1Q9JLM8 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Dclk1Q9JLM8 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Dclk1Q9JLM8 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Dclk1Q9JLM8 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Dclk1Q9JLM8 Prss51-204ENSMUST00000224112 1042 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Dclk1Q9JLM8 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Dclk1Q9JLM8 Psca-201ENSMUST00000023265 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Dclk1Q9JLM8 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Dclk1Q9JLM8 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Dclk1Q9JLM8 Atp5j2-201ENSMUST00000037056 540 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Dclk1Q9JLM8 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Dclk1Q9JLM8 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Dclk1Q9JLM8 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Dclk1Q9JLM8 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Dclk1Q9JLM8 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Dclk1Q9JLM8 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Dclk1Q9JLM8 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Dclk1Q9JLM8 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Dclk1Q9JLM8 Matr3-216ENSMUST00000190653 1846 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Dclk1Q9JLM8 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Dclk1Q9JLM8 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Dclk1Q9JLM8 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Dclk1Q9JLM8 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Dclk1Q9JLM8 Gm38344-201ENSMUST00000195306 1353 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Dclk1Q9JLM8 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Dclk1Q9JLM8 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Dclk1Q9JLM8 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Dclk1Q9JLM8 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Dclk1Q9JLM8 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Dclk1Q9JLM8 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Dclk1Q9JLM8 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Dclk1Q9JLM8 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Dclk1Q9JLM8 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Dclk1Q9JLM8 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Dclk1Q9JLM8 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Dclk1Q9JLM8 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Dclk1Q9JLM8 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Dclk1Q9JLM8 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Dclk1Q9JLM8 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Dclk1Q9JLM8 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Dclk1Q9JLM8 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Dclk1Q9JLM8 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Dclk1Q9JLM8 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Dclk1Q9JLM8 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Dclk1Q9JLM8 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Dclk1Q9JLM8 Gm14807-201ENSMUST00000116640 983 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Dclk1Q9JLM8 Gm12030-201ENSMUST00000121917 223 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Dclk1Q9JLM8 Smim1-204ENSMUST00000130175 477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Dclk1Q9JLM8 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Dclk1Q9JLM8 Gm24943-201ENSMUST00000158329 433 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Dclk1Q9JLM8 Gm21092-201ENSMUST00000178995 955 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Dclk1Q9JLM8 Gm7137-201ENSMUST00000180161 711 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Dclk1Q9JLM8 Gm42433-201ENSMUST00000196806 940 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Dclk1Q9JLM8 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Dclk1Q9JLM8 Gm3433-201ENSMUST00000210149 1058 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Dclk1Q9JLM8 Gm45310-201ENSMUST00000210436 275 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Dclk1Q9JLM8 Gm46336-201ENSMUST00000221894 279 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Dclk1Q9JLM8 Tex101-201ENSMUST00000078001 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Dclk1Q9JLM8 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Dclk1Q9JLM8 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.2 ms