Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESN2

Trim39, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM39, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim39Q9ESN2 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trim39Q9ESN2 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trim39Q9ESN2 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trim39Q9ESN2 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trim39Q9ESN2 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trim39Q9ESN2 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trim39Q9ESN2 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trim39Q9ESN2 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trim39Q9ESN2 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trim39Q9ESN2 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trim39Q9ESN2 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trim39Q9ESN2 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trim39Q9ESN2 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trim39Q9ESN2 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Trim39Q9ESN2 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trim39Q9ESN2 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trim39Q9ESN2 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trim39Q9ESN2 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trim39Q9ESN2 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trim39Q9ESN2 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trim39Q9ESN2 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trim39Q9ESN2 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trim39Q9ESN2 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trim39Q9ESN2 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trim39Q9ESN2 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trim39Q9ESN2 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trim39Q9ESN2 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trim39Q9ESN2 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trim39Q9ESN2 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trim39Q9ESN2 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trim39Q9ESN2 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trim39Q9ESN2 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trim39Q9ESN2 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trim39Q9ESN2 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trim39Q9ESN2 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trim39Q9ESN2 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trim39Q9ESN2 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Trim39Q9ESN2 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Trim39Q9ESN2 Ccl11-201ENSMUST00000000342 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trim39Q9ESN2 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trim39Q9ESN2 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Trim39Q9ESN2 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Trim39Q9ESN2 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trim39Q9ESN2 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Trim39Q9ESN2 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trim39Q9ESN2 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Trim39Q9ESN2 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Trim39Q9ESN2 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
Trim39Q9ESN2 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Trim39Q9ESN2 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC11.83□□□□□ -0.51
Trim39Q9ESN2 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Trim39Q9ESN2 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Trim39Q9ESN2 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Trim39Q9ESN2 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Trim39Q9ESN2 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Trim39Q9ESN2 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Trim39Q9ESN2 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Trim39Q9ESN2 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Trim39Q9ESN2 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Trim39Q9ESN2 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Trim39Q9ESN2 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Trim39Q9ESN2 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Trim39Q9ESN2 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Trim39Q9ESN2 Gm16140-201ENSMUST00000117191 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Trim39Q9ESN2 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Trim39Q9ESN2 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Trim39Q9ESN2 Gm13366-201ENSMUST00000122198 970 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Trim39Q9ESN2 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Trim39Q9ESN2 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Trim39Q9ESN2 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Trim39Q9ESN2 Gm22119-201ENSMUST00000175594 99 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Trim39Q9ESN2 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Trim39Q9ESN2 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Trim39Q9ESN2 Gm16833-202ENSMUST00000189204 672 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Trim39Q9ESN2 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Trim39Q9ESN2 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Trim39Q9ESN2 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms