Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCT6

Bap18, Chromatin complexes subunit BAP18, mousemouse

Predictions only

Length 171 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bap18Q9DCT6 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Bap18Q9DCT6 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Bap18Q9DCT6 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Bap18Q9DCT6 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Bap18Q9DCT6 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Bap18Q9DCT6 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Bap18Q9DCT6 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Bap18Q9DCT6 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Bap18Q9DCT6 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Bap18Q9DCT6 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Bap18Q9DCT6 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Bap18Q9DCT6 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Bap18Q9DCT6 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Bap18Q9DCT6 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Bap18Q9DCT6 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Bap18Q9DCT6 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Bap18Q9DCT6 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Bap18Q9DCT6 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Bap18Q9DCT6 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Bap18Q9DCT6 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Bap18Q9DCT6 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Bap18Q9DCT6 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Bap18Q9DCT6 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Bap18Q9DCT6 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Bap18Q9DCT6 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Bap18Q9DCT6 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Bap18Q9DCT6 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Bap18Q9DCT6 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Bap18Q9DCT6 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Bap18Q9DCT6 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Bap18Q9DCT6 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Bap18Q9DCT6 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Bap18Q9DCT6 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Bap18Q9DCT6 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Bap18Q9DCT6 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Bap18Q9DCT6 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Bap18Q9DCT6 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Bap18Q9DCT6 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Bap18Q9DCT6 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Bap18Q9DCT6 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Bap18Q9DCT6 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Bap18Q9DCT6 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Bap18Q9DCT6 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Bap18Q9DCT6 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Bap18Q9DCT6 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Bap18Q9DCT6 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Bap18Q9DCT6 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Bap18Q9DCT6 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Bap18Q9DCT6 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Bap18Q9DCT6 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Bap18Q9DCT6 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Bap18Q9DCT6 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Bap18Q9DCT6 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Bap18Q9DCT6 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Bap18Q9DCT6 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Bap18Q9DCT6 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Bap18Q9DCT6 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Bap18Q9DCT6 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Bap18Q9DCT6 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Bap18Q9DCT6 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Bap18Q9DCT6 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Bap18Q9DCT6 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Bap18Q9DCT6 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Bap18Q9DCT6 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Bap18Q9DCT6 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Bap18Q9DCT6 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Bap18Q9DCT6 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Bap18Q9DCT6 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Bap18Q9DCT6 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Bap18Q9DCT6 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Bap18Q9DCT6 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Bap18Q9DCT6 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Bap18Q9DCT6 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Bap18Q9DCT6 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Bap18Q9DCT6 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Bap18Q9DCT6 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Bap18Q9DCT6 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Bap18Q9DCT6 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Bap18Q9DCT6 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Bap18Q9DCT6 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Bap18Q9DCT6 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Bap18Q9DCT6 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Bap18Q9DCT6 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Bap18Q9DCT6 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Bap18Q9DCT6 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Bap18Q9DCT6 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Bap18Q9DCT6 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Bap18Q9DCT6 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Bap18Q9DCT6 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Bap18Q9DCT6 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Bap18Q9DCT6 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Bap18Q9DCT6 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Bap18Q9DCT6 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Bap18Q9DCT6 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Bap18Q9DCT6 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Bap18Q9DCT6 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Bap18Q9DCT6 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Bap18Q9DCT6 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Bap18Q9DCT6 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Bap18Q9DCT6 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.6 ms