Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft1Q9DCN7 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rnft1Q9DCN7 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rnft1Q9DCN7 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rnft1Q9DCN7 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rnft1Q9DCN7 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rnft1Q9DCN7 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rnft1Q9DCN7 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rnft1Q9DCN7 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rnft1Q9DCN7 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rnft1Q9DCN7 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rnft1Q9DCN7 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rnft1Q9DCN7 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rnft1Q9DCN7 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rnft1Q9DCN7 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Rnft1Q9DCN7 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rnft1Q9DCN7 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rnft1Q9DCN7 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Rnft1Q9DCN7 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Rnft1Q9DCN7 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rnft1Q9DCN7 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rnft1Q9DCN7 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Rnft1Q9DCN7 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rnft1Q9DCN7 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rnft1Q9DCN7 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Rnft1Q9DCN7 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rnft1Q9DCN7 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rnft1Q9DCN7 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rnft1Q9DCN7 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rnft1Q9DCN7 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rnft1Q9DCN7 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rnft1Q9DCN7 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rnft1Q9DCN7 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rnft1Q9DCN7 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rnft1Q9DCN7 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rnft1Q9DCN7 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rnft1Q9DCN7 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Rnft1Q9DCN7 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Rnft1Q9DCN7 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Rnft1Q9DCN7 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Rnft1Q9DCN7 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Rnft1Q9DCN7 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Rnft1Q9DCN7 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Rnft1Q9DCN7 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Rnft1Q9DCN7 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Rnft1Q9DCN7 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Rnft1Q9DCN7 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rnft1Q9DCN7 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rnft1Q9DCN7 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rnft1Q9DCN7 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rnft1Q9DCN7 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Rnft1Q9DCN7 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rnft1Q9DCN7 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rnft1Q9DCN7 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rnft1Q9DCN7 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rnft1Q9DCN7 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Rnft1Q9DCN7 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rnft1Q9DCN7 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Rnft1Q9DCN7 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Rnft1Q9DCN7 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Rnft1Q9DCN7 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rnft1Q9DCN7 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rnft1Q9DCN7 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rnft1Q9DCN7 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rnft1Q9DCN7 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rnft1Q9DCN7 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rnft1Q9DCN7 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rnft1Q9DCN7 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rnft1Q9DCN7 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rnft1Q9DCN7 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rnft1Q9DCN7 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rnft1Q9DCN7 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rnft1Q9DCN7 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rnft1Q9DCN7 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rnft1Q9DCN7 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rnft1Q9DCN7 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rnft1Q9DCN7 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rnft1Q9DCN7 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rnft1Q9DCN7 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rnft1Q9DCN7 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rnft1Q9DCN7 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rnft1Q9DCN7 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rnft1Q9DCN7 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rnft1Q9DCN7 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rnft1Q9DCN7 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rnft1Q9DCN7 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rnft1Q9DCN7 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rnft1Q9DCN7 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rnft1Q9DCN7 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Rnft1Q9DCN7 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rnft1Q9DCN7 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Rnft1Q9DCN7 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Rnft1Q9DCN7 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rnft1Q9DCN7 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rnft1Q9DCN7 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Rnft1Q9DCN7 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Rnft1Q9DCN7 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Rnft1Q9DCN7 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rnft1Q9DCN7 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rnft1Q9DCN7 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Rnft1Q9DCN7 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms