Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBQ9

Swt1, Transcriptional protein SWT1, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Swt1Q9DBQ9 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Swt1Q9DBQ9 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Swt1Q9DBQ9 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Swt1Q9DBQ9 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Swt1Q9DBQ9 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Swt1Q9DBQ9 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Swt1Q9DBQ9 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Swt1Q9DBQ9 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Swt1Q9DBQ9 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Swt1Q9DBQ9 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Swt1Q9DBQ9 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Swt1Q9DBQ9 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Swt1Q9DBQ9 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Swt1Q9DBQ9 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Swt1Q9DBQ9 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Swt1Q9DBQ9 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Swt1Q9DBQ9 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Swt1Q9DBQ9 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Swt1Q9DBQ9 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Swt1Q9DBQ9 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Swt1Q9DBQ9 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Swt1Q9DBQ9 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Swt1Q9DBQ9 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Swt1Q9DBQ9 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Swt1Q9DBQ9 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Swt1Q9DBQ9 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Swt1Q9DBQ9 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Swt1Q9DBQ9 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Swt1Q9DBQ9 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Swt1Q9DBQ9 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Swt1Q9DBQ9 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Swt1Q9DBQ9 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Swt1Q9DBQ9 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Swt1Q9DBQ9 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Swt1Q9DBQ9 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Swt1Q9DBQ9 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Swt1Q9DBQ9 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Swt1Q9DBQ9 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Swt1Q9DBQ9 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Swt1Q9DBQ9 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Swt1Q9DBQ9 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Swt1Q9DBQ9 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Swt1Q9DBQ9 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Swt1Q9DBQ9 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Swt1Q9DBQ9 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Swt1Q9DBQ9 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Swt1Q9DBQ9 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Swt1Q9DBQ9 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Swt1Q9DBQ9 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Swt1Q9DBQ9 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Swt1Q9DBQ9 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Swt1Q9DBQ9 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Swt1Q9DBQ9 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Swt1Q9DBQ9 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Swt1Q9DBQ9 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Swt1Q9DBQ9 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Swt1Q9DBQ9 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Swt1Q9DBQ9 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Swt1Q9DBQ9 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Swt1Q9DBQ9 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Swt1Q9DBQ9 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Swt1Q9DBQ9 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Swt1Q9DBQ9 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Swt1Q9DBQ9 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Swt1Q9DBQ9 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Swt1Q9DBQ9 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Swt1Q9DBQ9 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Swt1Q9DBQ9 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Swt1Q9DBQ9 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Swt1Q9DBQ9 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Swt1Q9DBQ9 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Swt1Q9DBQ9 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Swt1Q9DBQ9 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Swt1Q9DBQ9 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Swt1Q9DBQ9 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Swt1Q9DBQ9 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Swt1Q9DBQ9 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Swt1Q9DBQ9 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Swt1Q9DBQ9 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Swt1Q9DBQ9 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Swt1Q9DBQ9 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Swt1Q9DBQ9 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Swt1Q9DBQ9 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Swt1Q9DBQ9 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Swt1Q9DBQ9 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Swt1Q9DBQ9 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Swt1Q9DBQ9 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Swt1Q9DBQ9 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Swt1Q9DBQ9 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Swt1Q9DBQ9 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Swt1Q9DBQ9 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Swt1Q9DBQ9 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Swt1Q9DBQ9 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Swt1Q9DBQ9 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Swt1Q9DBQ9 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Swt1Q9DBQ9 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Swt1Q9DBQ9 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Swt1Q9DBQ9 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Swt1Q9DBQ9 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Swt1Q9DBQ9 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms